More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_15060 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  51.42 
 
 		 690 aa  638    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  53.31 
 
 		 712 aa  689    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  55.82 
 
 		 670 aa  669    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  53.87 
 
 		 704 aa  681    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  53.16 
 
 		 736 aa  650    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  62.3 
 
 		 717 aa  859    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 709 aa  1423    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  55.95 
 
 		 699 aa  702    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  55.22 
 
 		 685 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  54.51 
 
 		 689 aa  694    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  52.95 
 
 		 787 aa  703    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  53.89 
 
 		 702 aa  711    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  62.48 
 
 		 726 aa  867    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  59.83 
 
 		 701 aa  790    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  53.31 
 
 		 708 aa  706    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.27 
 
 		 710 aa  673    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  52.59 
 
 		 688 aa  684    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  50.62 
 
 		 710 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  55.24 
 
 		 684 aa  671    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  56.39 
 
 		 682 aa  712    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  54.73 
 
 		 694 aa  634  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  51.26 
 
 		 707 aa  630  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  51.81 
 
 		 719 aa  620  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  50.9 
 
 		 714 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  50.9 
 
 		 707 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  50.9 
 
 		 707 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  50.78 
 
 		 697 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  47.96 
 
 		 697 aa  612  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  52.04 
 
 		 719 aa  612  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  49.58 
 
 		 700 aa  609  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  52.33 
 
 		 685 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  50.43 
 
 		 674 aa  606  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  50.95 
 
 		 759 aa  604  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  49.93 
 
 		 717 aa  596  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  56.28 
 
 		 876 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  44.08 
 
 		 643 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  45.67 
 
 		 508 aa  299  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  44.36 
 
 		 515 aa  288  2.9999999999999996e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.31 
 
 		 715 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  32.64 
 
 		 739 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.96 
 
 		 762 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  29.68 
 
 		 625 aa  267  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  30.88 
 
 		 744 aa  264  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  30.39 
 
 		 689 aa  263  6.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.53 
 
 		 755 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.04 
 
 		 737 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.91 
 
 		 686 aa  258  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.78 
 
 		 671 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  29.69 
 
 		 714 aa  258  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  29.46 
 
 		 724 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.17 
 
 		 786 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.81 
 
 		 689 aa  255  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  29.22 
 
 		 807 aa  252  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 		 671 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  33.08 
 
 		 671 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.9 
 
 		 742 aa  250  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  30.2 
 
 		 678 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  30.44 
 
 		 678 aa  248  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  32.77 
 
 		 705 aa  247  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.43 
 
 		 757 aa  246  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  31.41 
 
 		 678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.23 
 
 		 725 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  28.76 
 
 		 735 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.97 
 
 		 718 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  33.28 
 
 		 682 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  29.89 
 
 		 678 aa  243  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  28.12 
 
 		 687 aa  242  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  30.91 
 
 		 707 aa  241  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.68 
 
 		 748 aa  240  5e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  31.1 
 
 		 680 aa  241  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  30.23 
 
 		 758 aa  240  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.96 
 
 		 833 aa  239  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  38.26 
 
 		 746 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  30.53 
 
 		 787 aa  238  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.96 
 
 		 753 aa  238  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  31.36 
 
 		 726 aa  237  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  30.54 
 
 		 762 aa  237  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.36 
 
 		 932 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.96 
 
 		 753 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.1 
 
 		 747 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  30.1 
 
 		 751 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.1 
 
 		 747 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.1 
 
 		 751 aa  235  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.1 
 
 		 751 aa  235  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  30.1 
 
 		 753 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.83 
 
 		 892 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  34.05 
 
 		 1050 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.1 
 
 		 751 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.51 
 
 		 741 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.12 
 
 		 797 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.56 
 
 		 747 aa  234  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  29.19 
 
 		 696 aa  233  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.1 
 
 		 732 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  31.93 
 
 		 798 aa  231  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  29.77 
 
 		 668 aa  231  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  28.5 
 
 		 743 aa  231  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.22 
 
 		 669 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.22 
 
 		 669 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.22 
 
 		 669 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  29.25 
 
 		 816 aa  230  7e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>