More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0281 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.4 
 
 		 725 aa  859    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  50.34 
 
 		 724 aa  736    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.56 
 
 		 729 aa  835    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.27 
 
 		 736 aa  793    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  74.24 
 
 		 729 aa  1131    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.25 
 
 		 733 aa  825    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.31 
 
 		 737 aa  795    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.67 
 
 		 725 aa  764    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  76.29 
 
 		 734 aa  1162    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 731 aa  1500    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.37 
 
 		 647 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.19 
 
 		 625 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.12 
 
 		 881 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.94 
 
 		 709 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.94 
 
 		 709 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.38 
 
 		 709 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.2 
 
 		 607 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.87 
 
 		 731 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.12 
 
 		 718 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  41.08 
 
 		 615 aa  469  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.53 
 
 		 599 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.18 
 
 		 599 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 		 606 aa  462  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.12 
 
 		 625 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.67 
 
 		 616 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.83 
 
 		 620 aa  458  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  41.13 
 
 		 618 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 		 606 aa  457  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.27 
 
 		 633 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.13 
 
 		 619 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 		 598 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.44 
 
 		 601 aa  454  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.64 
 
 		 711 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.08 
 
 		 615 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.57 
 
 		 611 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.13 
 
 		 602 aa  455  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 		 608 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  39.93 
 
 		 601 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.63 
 
 		 600 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 		 608 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.63 
 
 		 674 aa  452  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 		 622 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.5 
 
 		 611 aa  451  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.77 
 
 		 714 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 		 603 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 		 621 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.7 
 
 		 597 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 		 600 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.2 
 
 		 617 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.24 
 
 		 596 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.2 
 
 		 601 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.73 
 
 		 619 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.7 
 
 		 610 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.98 
 
 		 722 aa  448  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.02 
 
 		 715 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  40.34 
 
 		 600 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.7 
 
 		 610 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.73 
 
 		 601 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.73 
 
 		 598 aa  446  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.9 
 
 		 625 aa  446  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.49 
 
 		 605 aa  445  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.2 
 
 		 626 aa  441  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 		 599 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.46 
 
 		 717 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38 
 
 		 647 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 		 607 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.07 
 
 		 719 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.92 
 
 		 612 aa  438  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.3 
 
 		 707 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 		 611 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.93 
 
 		 739 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.04 
 
 		 599 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.56 
 
 		 599 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.19 
 
 		 609 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.24 
 
 		 625 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.37 
 
 		 612 aa  435  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  38.31 
 
 		 611 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.47 
 
 		 611 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.47 
 
 		 609 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.47 
 
 		 609 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.24 
 
 		 614 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.66 
 
 		 611 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.66 
 
 		 611 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.2 
 
 		 611 aa  435  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.76 
 
 		 607 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.47 
 
 		 611 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  38.31 
 
 		 609 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.47 
 
 		 609 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.69 
 
 		 710 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.34 
 
 		 607 aa  432  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.01 
 
 		 626 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.4 
 
 		 607 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.32 
 
 		 607 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.47 
 
 		 609 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.76 
 
 		 607 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.27 
 
 		 608 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.6 
 
 		 607 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  37.58 
 
 		 709 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.32 
 
 		 607 aa  429  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.32 
 
 		 607 aa  428  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>