More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0928 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 876 aa  1707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  74.06 
 
 		 694 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  70.6 
 
 		 710 aa  535  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  70.39 
 
 		 707 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  69.66 
 
 		 714 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  69.66 
 
 		 707 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  69.66 
 
 		 707 aa  515  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  64.05 
 
 		 697 aa  512  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  67.31 
 
 		 700 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  66.83 
 
 		 717 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  66.75 
 
 		 685 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  60.64 
 
 		 708 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  65.01 
 
 		 674 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  60.7 
 
 		 689 aa  475  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  62.59 
 
 		 697 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  61.4 
 
 		 702 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  60.05 
 
 		 682 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  57.92 
 
 		 712 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  61.23 
 
 		 759 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  60.7 
 
 		 719 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  60.6 
 
 		 736 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  60.2 
 
 		 719 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  56.56 
 
 		 787 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  56.8 
 
 		 717 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  57.11 
 
 		 701 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  57.99 
 
 		 726 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  54.92 
 
 		 690 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  57.14 
 
 		 699 aa  422  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  56.27 
 
 		 709 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.99 
 
 		 710 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  58.46 
 
 		 684 aa  409  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  60.55 
 
 		 670 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  58.37 
 
 		 685 aa  402  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  54.22 
 
 		 688 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  53.6 
 
 		 704 aa  382  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  48.53 
 
 		 508 aa  303  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  47.43 
 
 		 643 aa  293  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  33.98 
 
 		 807 aa  256  9e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  40.4 
 
 		 739 aa  251  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.75 
 
 		 715 aa  251  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.04 
 
 		 773 aa  250  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.31 
 
 		 858 aa  249  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  41.56 
 
 		 515 aa  249  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.68 
 
 		 932 aa  249  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.48 
 
 		 762 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  35.66 
 
 		 714 aa  248  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0950  UvrD/REP helicase  30.45 
 
 		 813 aa  248  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000846771 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.35 
 
 		 781 aa  245  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  34.07 
 
 		 689 aa  245  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  41.52 
 
 		 715 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  35.54 
 
 		 689 aa  244  5e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.61 
 
 		 768 aa  243  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.86 
 
 		 742 aa  243  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.92 
 
 		 763 aa  242  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.11 
 
 		 781 aa  240  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  35.75 
 
 		 779 aa  240  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  37.91 
 
 		 812 aa  239  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  38.12 
 
 		 768 aa  239  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40 
 
 		 694 aa  238  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  38.67 
 
 		 746 aa  238  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  31.98 
 
 		 687 aa  238  4e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.14 
 
 		 795 aa  238  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.36 
 
 		 737 aa  237  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.89 
 
 		 755 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.88 
 
 		 830 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.29 
 
 		 837 aa  235  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.58 
 
 		 765 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  35.05 
 
 		 724 aa  235  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  36.32 
 
 		 681 aa  235  4.0000000000000004e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.6 
 
 		 806 aa  234  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.21 
 
 		 732 aa  234  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.59 
 
 		 838 aa  234  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.23 
 
 		 786 aa  234  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  39.18 
 
 		 771 aa  233  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.92 
 
 		 802 aa  233  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  36.36 
 
 		 737 aa  232  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  36 
 
 		 841 aa  231  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.65 
 
 		 794 aa  231  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.3 
 
 		 829 aa  230  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  38.56 
 
 		 732 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  38.06 
 
 		 731 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.45 
 
 		 896 aa  229  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.71 
 
 		 851 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  36.32 
 
 		 744 aa  228  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.9 
 
 		 780 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  33.98 
 
 		 770 aa  228  5.0000000000000005e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.41 
 
 		 775 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.74 
 
 		 725 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.89 
 
 		 754 aa  227  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.97 
 
 		 784 aa  227  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.2 
 
 		 686 aa  226  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  37.13 
 
 		 790 aa  226  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.65 
 
 		 831 aa  226  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.47 
 
 		 828 aa  226  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.86 
 
 		 785 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.52 
 
 		 772 aa  226  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.86 
 
 		 785 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  37.25 
 
 		 707 aa  226  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  33.98 
 
 		 769 aa  226  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.17 
 
 		 757 aa  226  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>