More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0530 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  53.43 
 
 		 759 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  53.74 
 
 		 709 aa  684    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  55.34 
 
 		 685 aa  641    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  54.39 
 
 		 674 aa  658    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  62.23 
 
 		 689 aa  801    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 712 aa  1434    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  54.72 
 
 		 697 aa  676    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  54.35 
 
 		 736 aa  679    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  65.35 
 
 		 682 aa  835    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  54.88 
 
 		 694 aa  653    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  53.4 
 
 		 714 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  71.64 
 
 		 708 aa  981    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  63.74 
 
 		 702 aa  835    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  55.4 
 
 		 701 aa  735    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  55.2 
 
 		 726 aa  728    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  51.57 
 
 		 704 aa  643    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  54.09 
 
 		 688 aa  666    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  53.4 
 
 		 707 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  53.34 
 
 		 710 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  51.5 
 
 		 700 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  51.99 
 
 		 697 aa  674    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  55.83 
 
 		 719 aa  663    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  55.27 
 
 		 717 aa  727    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  53.4 
 
 		 707 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  54.1 
 
 		 787 aa  733    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  53.56 
 
 		 707 aa  644    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  54.39 
 
 		 719 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  52.67 
 
 		 717 aa  634  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.12 
 
 		 699 aa  631  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  48.84 
 
 		 710 aa  617  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  52.25 
 
 		 684 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  51.98 
 
 		 685 aa  598  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  52.17 
 
 		 670 aa  598  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  46.71 
 
 		 690 aa  590  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  57.92 
 
 		 876 aa  438  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  43.78 
 
 		 643 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  45.41 
 
 		 508 aa  299  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  41.54 
 
 		 515 aa  284  5.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.23 
 
 		 730 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  29.7 
 
 		 625 aa  267  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  31.14 
 
 		 735 aa  264  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  26.95 
 
 		 687 aa  257  5e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  33.18 
 
 		 739 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  34.42 
 
 		 721 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  27.61 
 
 		 689 aa  252  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  32.04 
 
 		 817 aa  251  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.87 
 
 		 851 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  27.13 
 
 		 689 aa  251  5e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  33.28 
 
 		 620 aa  249  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  34.27 
 
 		 715 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.58 
 
 		 763 aa  248  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  32.1 
 
 		 800 aa  244  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  35.53 
 
 		 1050 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.45 
 
 		 729 aa  242  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.46 
 
 		 686 aa  243  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 790 aa  242  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  34.19 
 
 		 682 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  33.49 
 
 		 714 aa  241  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  32.62 
 
 		 726 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  29.57 
 
 		 743 aa  239  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.81 
 
 		 785 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  32.57 
 
 		 795 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  32.37 
 
 		 798 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  30.83 
 
 		 668 aa  235  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  27.57 
 
 		 735 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  32.57 
 
 		 795 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  28.25 
 
 		 741 aa  233  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  34.24 
 
 		 1032 aa  232  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.51 
 
 		 662 aa  231  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.86 
 
 		 715 aa  231  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  34.47 
 
 		 1089 aa  230  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  29.92 
 
 		 681 aa  230  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  30.14 
 
 		 731 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.6 
 
 		 732 aa  229  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  30.77 
 
 		 744 aa  228  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  29.97 
 
 		 634 aa  227  7e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  31.33 
 
 		 807 aa  226  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  29.69 
 
 		 723 aa  226  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.25 
 
 		 742 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  29.08 
 
 		 669 aa  224  6e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  30.45 
 
 		 745 aa  224  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 		 787 aa  223  8e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  30.91 
 
 		 1232 aa  223  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.92 
 
 		 768 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  32.4 
 
 		 816 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  33.94 
 
 		 705 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  27.82 
 
 		 655 aa  221  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  31.17 
 
 		 753 aa  221  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  29.02 
 
 		 696 aa  221  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  32.81 
 
 		 797 aa  220  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0110  superfamily I DNA and RNA helicase  36.4 
 
 		 401 aa  220  7e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.285644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 		 1124 aa  220  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  30.32 
 
 		 743 aa  219  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 735 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  28.01 
 
 		 682 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  34.09 
 
 		 768 aa  218  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  30.92 
 
 		 825 aa  218  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  29.8 
 
 		 726 aa  217  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.03 
 
 		 794 aa  216  8e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  33.64 
 
 		 666 aa  216  8e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>