More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19150 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  53.97 
 
 		 682 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 704 aa  1405    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  57.08 
 
 		 717 aa  729    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  51.57 
 
 		 712 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  54.83 
 
 		 684 aa  644    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  55.22 
 
 		 726 aa  703    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  53.87 
 
 		 709 aa  675    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  56.58 
 
 		 701 aa  723    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  53.98 
 
 		 699 aa  652    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  50 
 
 		 787 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.51 
 
 		 710 aa  627  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  51.71 
 
 		 688 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  49.44 
 
 		 708 aa  624  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  53.43 
 
 		 685 aa  624  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.86 
 
 		 689 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  52.01 
 
 		 702 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  49.64 
 
 		 690 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  52.18 
 
 		 670 aa  598  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  49.65 
 
 		 736 aa  598  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  48.99 
 
 		 697 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  49.49 
 
 		 674 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  48.45 
 
 		 719 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  48.55 
 
 		 719 aa  559  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  49.59 
 
 		 759 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.95 
 
 		 694 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  48.85 
 
 		 685 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  46.36 
 
 		 710 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  46.38 
 
 		 707 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  44.65 
 
 		 697 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  45.8 
 
 		 717 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  46.27 
 
 		 700 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  47.08 
 
 		 714 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  47.08 
 
 		 707 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  47.08 
 
 		 707 aa  502  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  53.6 
 
 		 876 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  44.04 
 
 		 643 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  46.38 
 
 		 508 aa  291  4e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.57 
 
 		 786 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.43 
 
 		 763 aa  263  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  30.55 
 
 		 696 aa  257  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  33.59 
 
 		 739 aa  256  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.84 
 
 		 725 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  28.64 
 
 		 787 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.86 
 
 		 732 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  39.13 
 
 		 515 aa  251  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.03 
 
 		 795 aa  246  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  27.69 
 
 		 687 aa  246  9e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.83 
 
 		 794 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.18 
 
 		 715 aa  243  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  29.88 
 
 		 671 aa  243  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.19 
 
 		 833 aa  243  7.999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.91 
 
 		 858 aa  243  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  29.26 
 
 		 714 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.26 
 
 		 829 aa  241  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  35.93 
 
 		 1032 aa  239  9e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.4 
 
 		 729 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.07 
 
 		 830 aa  239  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.64 
 
 		 754 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.48 
 
 		 837 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  37.38 
 
 		 715 aa  236  8e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  32.7 
 
 		 706 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  27.75 
 
 		 735 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.67 
 
 		 773 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  29.62 
 
 		 620 aa  233  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  30.73 
 
 		 669 aa  233  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.54 
 
 		 768 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  28.41 
 
 		 743 aa  232  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.15 
 
 		 738 aa  231  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  32.04 
 
 		 738 aa  231  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.24 
 
 		 772 aa  231  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.73 
 
 		 896 aa  231  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  31.61 
 
 		 738 aa  231  5e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.15 
 
 		 762 aa  230  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  34.54 
 
 		 762 aa  230  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.01 
 
 		 689 aa  230  8e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.2 
 
 		 685 aa  229  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.32 
 
 		 781 aa  228  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.81 
 
 		 781 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.29 
 
 		 686 aa  228  4e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  27.31 
 
 		 724 aa  226  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  28.14 
 
 		 741 aa  225  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.1 
 
 		 831 aa  226  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.58 
 
 		 730 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.09 
 
 		 765 aa  224  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  30.21 
 
 		 668 aa  223  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  35.63 
 
 		 771 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.36 
 
 		 851 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  29.87 
 
 		 845 aa  221  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  34.97 
 
 		 1050 aa  221  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.72 
 
 		 857 aa  221  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.08 
 
 		 755 aa  220  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  30.38 
 
 		 616 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  33.89 
 
 		 706 aa  218  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2919  UvrD/REP helicase  29.13 
 
 		 621 aa  219  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  33.47 
 
 		 744 aa  218  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  30.71 
 
 		 807 aa  218  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.26 
 
 		 932 aa  217  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.26 
 
 		 841 aa  216  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  34.92 
 
 		 705 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.26 
 
 		 864 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>