More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13220 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  61.71 
 
 		 717 aa  791    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  50.84 
 
 		 717 aa  636    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  52.42 
 
 		 708 aa  661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  53.8 
 
 		 689 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  52.07 
 
 		 712 aa  653    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  76.33 
 
 		 707 aa  1038    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  55.04 
 
 		 682 aa  650    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  58.07 
 
 		 685 aa  691    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  78.47 
 
 		 714 aa  1060    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  59.14 
 
 		 694 aa  722    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  78.61 
 
 		 707 aa  1060    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  59.77 
 
 		 697 aa  791    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  50.85 
 
 		 726 aa  635    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  100 
 
 		 700 aa  1394    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  53.25 
 
 		 702 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  78.47 
 
 		 707 aa  1059    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  77.19 
 
 		 710 aa  1047    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  53.28 
 
 		 697 aa  633  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  53.84 
 
 		 674 aa  630  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  50.57 
 
 		 701 aa  630  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  49.32 
 
 		 787 aa  628  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  52.84 
 
 		 736 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  50 
 
 		 709 aa  620  1e-176  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  54.18 
 
 		 719 aa  617  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  54.25 
 
 		 719 aa  611  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  51.74 
 
 		 759 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  51.22 
 
 		 684 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.81 
 
 		 710 aa  568  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  49.09 
 
 		 688 aa  558  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  48.56 
 
 		 699 aa  556  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  50 
 
 		 685 aa  548  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  49.21 
 
 		 670 aa  532  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.06 
 
 		 704 aa  523  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  67.31 
 
 		 876 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  43.51 
 
 		 690 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  44.56 
 
 		 643 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.33 
 
 		 732 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  30.45 
 
 		 689 aa  276  7e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.83 
 
 		 689 aa  276  9e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.6 
 
 		 718 aa  274  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  31.53 
 
 		 807 aa  273  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  44.56 
 
 		 508 aa  273  9e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  33.73 
 
 		 728 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  31.04 
 
 		 714 aa  270  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  33.58 
 
 		 728 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  34.45 
 
 		 739 aa  267  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  35.25 
 
 		 715 aa  266  1e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  34.15 
 
 		 768 aa  262  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.64 
 
 		 685 aa  261  5.0000000000000005e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.54 
 
 		 773 aa  260  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  33.03 
 
 		 751 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  30.34 
 
 		 625 aa  257  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.71 
 
 		 741 aa  256  9e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.62 
 
 		 797 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  32.29 
 
 		 727 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 		 724 aa  251  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.48 
 
 		 729 aa  251  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  39.9 
 
 		 515 aa  249  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  35.04 
 
 		 797 aa  249  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  33.88 
 
 		 797 aa  248  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  33.08 
 
 		 762 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  32.59 
 
 		 720 aa  247  6e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  34.76 
 
 		 725 aa  247  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  39.51 
 
 		 746 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  32.44 
 
 		 723 aa  244  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  32.28 
 
 		 726 aa  244  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  32.8 
 
 		 760 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  31.35 
 
 		 723 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  30.8 
 
 		 724 aa  241  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.15 
 
 		 658 aa  240  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  30.7 
 
 		 724 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.84 
 
 		 658 aa  237  4e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0110  superfamily I DNA and RNA helicase  39.32 
 
 		 401 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.285644  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  36.76 
 
 		 728 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  27.48 
 
 		 687 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  27.69 
 
 		 726 aa  234  3e-60  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.29 
 
 		 858 aa  234  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  31.63 
 
 		 707 aa  234  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.64 
 
 		 768 aa  233  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.5 
 
 		 762 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.1 
 
 		 725 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.88 
 
 		 765 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.03 
 
 		 892 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.16 
 
 		 742 aa  231  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.16 
 
 		 730 aa  231  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  31.98 
 
 		 825 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  29.75 
 
 		 816 aa  231  4e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.65 
 
 		 715 aa  230  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  36.71 
 
 		 744 aa  230  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  36.57 
 
 		 726 aa  230  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  36.65 
 
 		 726 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.09 
 
 		 806 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2436  UvrD/REP helicase  31.49 
 
 		 778 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0016628  normal  0.650689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  38.59 
 
 		 721 aa  229  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  31.46 
 
 		 817 aa  229  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  32.06 
 
 		 770 aa  228  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.64 
 
 		 694 aa  228  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  31.24 
 
 		 783 aa  228  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  31.16 
 
 		 858 aa  227  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  38.44 
 
 		 742 aa  227  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>