More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  55.95 
 
 		 709 aa  705    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.28 
 
 		 710 aa  654    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  51.98 
 
 		 712 aa  643    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  71.9 
 
 		 685 aa  894    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  64.3 
 
 		 684 aa  797    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  52.82 
 
 		 708 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  59.6 
 
 		 701 aa  778    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  54.12 
 
 		 704 aa  658    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 699 aa  1399    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  55.04 
 
 		 682 aa  670    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  53.47 
 
 		 689 aa  660    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  54.44 
 
 		 674 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  67.12 
 
 		 670 aa  814    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  57.69 
 
 		 717 aa  755    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  56.97 
 
 		 726 aa  748    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  57.98 
 
 		 690 aa  738    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  54.35 
 
 		 702 aa  659    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  52.43 
 
 		 736 aa  633  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  52.96 
 
 		 688 aa  628  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  51.1 
 
 		 787 aa  624  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.05 
 
 		 694 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  50 
 
 		 697 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  50.27 
 
 		 759 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  49.93 
 
 		 697 aa  569  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  49.21 
 
 		 710 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  49.57 
 
 		 717 aa  565  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  49.86 
 
 		 707 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  49.86 
 
 		 714 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  48.28 
 
 		 700 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  49.86 
 
 		 707 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  51.4 
 
 		 685 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  49.14 
 
 		 707 aa  557  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  49.86 
 
 		 719 aa  542  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  49.93 
 
 		 719 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  57.14 
 
 		 876 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  45.49 
 
 		 643 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  35.36 
 
 		 515 aa  317  4e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  46.01 
 
 		 508 aa  296  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0110  superfamily I DNA and RNA helicase  39.46 
 
 		 401 aa  265  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.285644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  33.65 
 
 		 739 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.94 
 
 		 737 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.23 
 
 		 694 aa  251  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  31.8 
 
 		 744 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  33.74 
 
 		 714 aa  241  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  32.31 
 
 		 706 aa  239  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.01 
 
 		 742 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.47 
 
 		 718 aa  237  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.17 
 
 		 786 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  37.83 
 
 		 715 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  28.41 
 
 		 741 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  31.65 
 
 		 726 aa  232  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.83 
 
 		 729 aa  230  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  30.45 
 
 		 790 aa  229  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 845 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  31.41 
 
 		 795 aa  227  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 706 aa  227  6e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  27.79 
 
 		 755 aa  226  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  32.44 
 
 		 800 aa  226  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  31.41 
 
 		 795 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.06 
 
 		 795 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  30.92 
 
 		 760 aa  225  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 		 735 aa  224  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.65 
 
 		 773 aa  224  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.3 
 
 		 794 aa  223  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  28.57 
 
 		 689 aa  223  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.57 
 
 		 729 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 669 aa  222  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  31.19 
 
 		 762 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.5 
 
 		 725 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  26.75 
 
 		 749 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  28.25 
 
 		 735 aa  220  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  27.08 
 
 		 764 aa  220  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  35.99 
 
 		 751 aa  220  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  28.91 
 
 		 743 aa  219  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.84 
 
 		 896 aa  219  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.74 
 
 		 748 aa  219  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.94 
 
 		 730 aa  219  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.94 
 
 		 730 aa  219  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  32.13 
 
 		 816 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  32.27 
 
 		 724 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  29.97 
 
 		 688 aa  218  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  28.4 
 
 		 723 aa  218  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  29.81 
 
 		 678 aa  217  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  29.11 
 
 		 739 aa  217  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.22 
 
 		 831 aa  217  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  32.1 
 
 		 726 aa  217  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.43 
 
 		 715 aa  217  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  28.48 
 
 		 678 aa  217  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  31.39 
 
 		 738 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.49 
 
 		 772 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  35.04 
 
 		 746 aa  216  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.43 
 
 		 876 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  28.71 
 
 		 696 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.75 
 
 		 763 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  28.15 
 
 		 634 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 745 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  28.57 
 
 		 816 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.51 
 
 		 755 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.52 
 
 		 713 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.69 
 
 		 754 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>