More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0426 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  49.93 
 
 
729 aa  743    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.93 
 
 
747 aa  743    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.3 
 
 
759 aa  714    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.53 
 
 
751 aa  735    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  50.6 
 
 
753 aa  739    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  50.4 
 
 
751 aa  735    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  51 
 
 
732 aa  754    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.6 
 
 
747 aa  733    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.6 
 
 
725 aa  722    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.73 
 
 
753 aa  743    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.78 
 
 
730 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.53 
 
 
751 aa  738    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  51.93 
 
 
741 aa  758    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.31 
 
 
756 aa  667    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.53 
 
 
747 aa  735    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.2 
 
 
751 aa  738    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  54.88 
 
 
757 aa  814    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.13 
 
 
729 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.2 
 
 
730 aa  751    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.86 
 
 
753 aa  737    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.82 
 
 
741 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  49.15 
 
 
758 aa  737    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  100 
 
 
748 aa  1543    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  50.2 
 
 
757 aa  722    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  57.54 
 
 
766 aa  854    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  49.42 
 
 
770 aa  714    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.2 
 
 
730 aa  751    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.31 
 
 
755 aa  635  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.27 
 
 
711 aa  635  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.46 
 
 
754 aa  621  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.46 
 
 
737 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.64 
 
 
785 aa  611  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.61 
 
 
751 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.61 
 
 
751 aa  595  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.28 
 
 
715 aa  598  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  41.77 
 
 
707 aa  595  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  42.27 
 
 
744 aa  595  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  42.65 
 
 
731 aa  594  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  41.87 
 
 
762 aa  592  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.15 
 
 
765 aa  589  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.74 
 
 
718 aa  590  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.17 
 
 
786 aa  587  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.5 
 
 
742 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.85 
 
 
768 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  41.86 
 
 
768 aa  581  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.93 
 
 
806 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.21 
 
 
781 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  40.68 
 
 
739 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  40.69 
 
 
736 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.89 
 
 
829 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.5 
 
 
797 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.61 
 
 
831 aa  568  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  42.76 
 
 
726 aa  567  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.81 
 
 
773 aa  566  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  41.03 
 
 
738 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  40.46 
 
 
779 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.98 
 
 
738 aa  559  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  40.63 
 
 
737 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.5 
 
 
851 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.43 
 
 
833 aa  560  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.65 
 
 
781 aa  558  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  41.66 
 
 
732 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.37 
 
 
772 aa  554  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.5 
 
 
858 aa  554  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  41.18 
 
 
731 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.6 
 
 
762 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.21 
 
 
795 aa  555  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  40.69 
 
 
738 aa  555  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  40.08 
 
 
757 aa  549  1e-155  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.9 
 
 
794 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.41 
 
 
763 aa  550  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  40.34 
 
 
762 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.93 
 
 
857 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  41.42 
 
 
746 aa  546  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  43.85 
 
 
705 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  39.25 
 
 
723 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  38.83 
 
 
807 aa  543  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  39.46 
 
 
721 aa  544  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.85 
 
 
802 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  39.6 
 
 
720 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  39.6 
 
 
720 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  39.2 
 
 
722 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  39.6 
 
 
720 aa  539  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  39.6 
 
 
720 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  40.4 
 
 
720 aa  541  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  40.4 
 
 
751 aa  542  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  40.37 
 
 
720 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.3 
 
 
858 aa  542  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  40.15 
 
 
812 aa  540  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  39.44 
 
 
722 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.61 
 
 
817 aa  538  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  39.6 
 
 
720 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  39.97 
 
 
720 aa  538  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  39.6 
 
 
720 aa  538  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  39.44 
 
 
722 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  39.6 
 
 
720 aa  538  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  39.3 
 
 
722 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  38.77 
 
 
722 aa  538  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  39.44 
 
 
722 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  39.07 
 
 
722 aa  538  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>