More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1807 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  52.68 
 
 		 717 aa  659    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  51.36 
 
 		 787 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  63.53 
 
 		 717 aa  801    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  54 
 
 		 712 aa  670    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  61.69 
 
 		 694 aa  743    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  54.96 
 
 		 674 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.76 
 
 		 709 aa  649    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  77.19 
 
 		 700 aa  1048    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  56 
 
 		 682 aa  664    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  59.37 
 
 		 685 aa  691    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  81.44 
 
 		 714 aa  1113    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  54.07 
 
 		 689 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  60.83 
 
 		 697 aa  794    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  55.08 
 
 		 708 aa  695    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  52.6 
 
 		 726 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  52.06 
 
 		 701 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  54.07 
 
 		 697 aa  640    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  81.44 
 
 		 707 aa  1113    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 710 aa  1424    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  81.73 
 
 		 707 aa  1118    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  89.58 
 
 		 707 aa  1248    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  55.52 
 
 		 702 aa  679    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  53.19 
 
 		 736 aa  622  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  53.4 
 
 		 719 aa  620  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  53.59 
 
 		 719 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  54.15 
 
 		 759 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  51.35 
 
 		 684 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.7 
 
 		 710 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  49.5 
 
 		 699 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  48.66 
 
 		 688 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  50.22 
 
 		 685 aa  557  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  50.93 
 
 		 670 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  70.6 
 
 		 876 aa  534  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  46.01 
 
 		 690 aa  534  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.91 
 
 		 704 aa  532  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  41.64 
 
 		 643 aa  335  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  46.55 
 
 		 508 aa  302  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  35.21 
 
 		 744 aa  287  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  35.74 
 
 		 739 aa  283  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  30.43 
 
 		 689 aa  281  3e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  34.15 
 
 		 768 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.1 
 
 		 785 aa  275  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.02 
 
 		 694 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  31.8 
 
 		 714 aa  272  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  30.7 
 
 		 807 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  35.29 
 
 		 746 aa  270  7e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  37.11 
 
 		 715 aa  270  8e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  31 
 
 		 681 aa  270  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  34.18 
 
 		 707 aa  268  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.07 
 
 		 715 aa  267  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.72 
 
 		 689 aa  265  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.86 
 
 		 741 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  32.38 
 
 		 765 aa  264  4.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.57 
 
 		 766 aa  263  8.999999999999999e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  30.53 
 
 		 625 aa  262  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  33.58 
 
 		 762 aa  262  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.23 
 
 		 773 aa  261  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  33.79 
 
 		 751 aa  258  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  32.44 
 
 		 728 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.25 
 
 		 765 aa  254  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  32.77 
 
 		 728 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.82 
 
 		 685 aa  253  9.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  35.17 
 
 		 797 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  34.84 
 
 		 659 aa  253  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.91 
 
 		 671 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.65 
 
 		 732 aa  252  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  38.75 
 
 		 515 aa  251  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  32.89 
 
 		 759 aa  251  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.48 
 
 		 838 aa  251  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.04 
 
 		 806 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  32.77 
 
 		 705 aa  249  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  32.78 
 
 		 728 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  34.4 
 
 		 795 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.93 
 
 		 755 aa  248  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  29.72 
 
 		 816 aa  248  4e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 		 678 aa  247  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  34.28 
 
 		 671 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.83 
 
 		 737 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  34.25 
 
 		 798 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  32.66 
 
 		 900 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.78 
 
 		 742 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.96 
 
 		 851 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  34.13 
 
 		 671 aa  245  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  30.32 
 
 		 762 aa  245  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  32.44 
 
 		 726 aa  243  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  33.59 
 
 		 741 aa  243  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  31.4 
 
 		 678 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  34.21 
 
 		 795 aa  242  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  32.1 
 
 		 724 aa  242  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  29.37 
 
 		 749 aa  242  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.53 
 
 		 753 aa  241  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.13 
 
 		 686 aa  241  5e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  32.07 
 
 		 825 aa  240  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  29.97 
 
 		 764 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  33.98 
 
 		 797 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  32.09 
 
 		 790 aa  238  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  32.59 
 
 		 706 aa  238  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  31.87 
 
 		 858 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.7 
 
 		 753 aa  238  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.07 
 
 		 747 aa  237  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>