More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0461 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 715 aa  1409    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.23 
 
 		 729 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.97 
 
 		 754 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.39 
 
 		 831 aa  585  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.44 
 
 		 768 aa  585  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  45.65 
 
 		 762 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.97 
 
 		 838 aa  578  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.43 
 
 		 795 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.72 
 
 		 786 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.7 
 
 		 794 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.03 
 
 		 765 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  49.71 
 
 		 851 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.89 
 
 		 806 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.48 
 
 		 763 aa  571  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.6 
 
 		 781 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.83 
 
 		 773 aa  568  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.58 
 
 		 781 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.84 
 
 		 732 aa  558  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.19 
 
 		 858 aa  553  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.55 
 
 		 729 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.17 
 
 		 817 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.16 
 
 		 833 aa  555  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.47 
 
 		 725 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.42 
 
 		 829 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.27 
 
 		 741 aa  547  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  46.18 
 
 		 771 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.62 
 
 		 775 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.75 
 
 		 858 aa  542  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.17 
 
 		 753 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.86 
 
 		 730 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.86 
 
 		 730 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.26 
 
 		 857 aa  541  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.27 
 
 		 747 aa  538  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.3 
 
 		 753 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.38 
 
 		 780 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.22 
 
 		 797 aa  537  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.57 
 
 		 802 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.41 
 
 		 751 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  39.57 
 
 		 753 aa  535  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  39.41 
 
 		 751 aa  535  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.41 
 
 		 747 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.84 
 
 		 715 aa  532  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.41 
 
 		 751 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.47 
 
 		 747 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.41 
 
 		 751 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.7 
 
 		 830 aa  534  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.91 
 
 		 784 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.37 
 
 		 785 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.37 
 
 		 785 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.66 
 
 		 762 aa  527  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.66 
 
 		 828 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.49 
 
 		 837 aa  528  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.93 
 
 		 755 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.45 
 
 		 896 aa  528  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  44.37 
 
 		 707 aa  528  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  44.97 
 
 		 900 aa  524  1e-147  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  43.26 
 
 		 736 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.66 
 
 		 737 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.29 
 
 		 694 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.23 
 
 		 1023 aa  522  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.16 
 
 		 757 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.73 
 
 		 741 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.02 
 
 		 864 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  38.52 
 
 		 757 aa  510  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  42.26 
 
 		 739 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.51 
 
 		 742 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  42.57 
 
 		 759 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  41.32 
 
 		 751 aa  505  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.88 
 
 		 772 aa  504  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.86 
 
 		 718 aa  502  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  42.13 
 
 		 768 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  41.31 
 
 		 714 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.57 
 
 		 756 aa  501  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  43.07 
 
 		 746 aa  501  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  40.72 
 
 		 744 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  42.86 
 
 		 721 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.64 
 
 		 766 aa  499  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  38.01 
 
 		 731 aa  502  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.32 
 
 		 738 aa  496  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.36 
 
 		 730 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.42 
 
 		 759 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.15 
 
 		 751 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.28 
 
 		 751 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  40.05 
 
 		 738 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  40.46 
 
 		 738 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.75 
 
 		 785 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.78 
 
 		 711 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  38.71 
 
 		 779 aa  485  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  41.31 
 
 		 735 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  40.65 
 
 		 730 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  42.31 
 
 		 760 aa  481  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  42.01 
 
 		 706 aa  479  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.77 
 
 		 772 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  39.89 
 
 		 713 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  39.4 
 
 		 720 aa  477  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  39.4 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  39.4 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  39.4 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.69 
 
 		 781 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  38.87 
 
 		 721 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>