More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_979 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  98.37 
 
 		 738 aa  1488    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  49.6 
 
 		 758 aa  696    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.67 
 
 		 785 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  50.8 
 
 		 759 aa  729    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  48.38 
 
 		 742 aa  667    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.28 
 
 		 732 aa  659    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  94.31 
 
 		 738 aa  1407    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 738 aa  1511    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  45.97 
 
 		 779 aa  653    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  48.99 
 
 		 751 aa  718    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.18 
 
 		 715 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.25 
 
 		 757 aa  629  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.66 
 
 		 755 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.81 
 
 		 742 aa  628  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.25 
 
 		 741 aa  626  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.1 
 
 		 729 aa  625  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.74 
 
 		 730 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.74 
 
 		 730 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.61 
 
 		 741 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.71 
 
 		 786 aa  616  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  45.73 
 
 		 707 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  44.05 
 
 		 739 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.55 
 
 		 747 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  46.65 
 
 		 736 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.55 
 
 		 725 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.41 
 
 		 737 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.41 
 
 		 730 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  44.05 
 
 		 762 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.3 
 
 		 753 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  42.4 
 
 		 757 aa  610  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  45.06 
 
 		 744 aa  611  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.55 
 
 		 751 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.55 
 
 		 751 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.77 
 
 		 729 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.55 
 
 		 751 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  42.55 
 
 		 751 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.55 
 
 		 747 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.85 
 
 		 711 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  42.7 
 
 		 753 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.7 
 
 		 753 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.11 
 
 		 747 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  44 
 
 		 768 aa  600  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.39 
 
 		 759 aa  598  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.01 
 
 		 751 aa  595  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.04 
 
 		 751 aa  597  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.93 
 
 		 766 aa  595  1e-168  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.62 
 
 		 831 aa  588  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.55 
 
 		 718 aa  591  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.01 
 
 		 754 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.24 
 
 		 858 aa  586  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.05 
 
 		 765 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  39.87 
 
 		 770 aa  588  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.46 
 
 		 763 aa  586  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  45 
 
 		 732 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.96 
 
 		 756 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.58 
 
 		 833 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.47 
 
 		 758 aa  583  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.78 
 
 		 773 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  43.97 
 
 		 737 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.67 
 
 		 768 aa  582  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  45.14 
 
 		 731 aa  581  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.5 
 
 		 857 aa  581  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.69 
 
 		 781 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.24 
 
 		 851 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.03 
 
 		 748 aa  572  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.83 
 
 		 829 aa  571  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  42.71 
 
 		 771 aa  568  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.5 
 
 		 806 aa  568  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.48 
 
 		 838 aa  568  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.12 
 
 		 794 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.29 
 
 		 896 aa  561  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.85 
 
 		 694 aa  559  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.99 
 
 		 795 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.88 
 
 		 817 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.64 
 
 		 830 aa  558  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  42.93 
 
 		 762 aa  556  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.67 
 
 		 837 aa  552  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.63 
 
 		 797 aa  555  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.16 
 
 		 772 aa  549  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  41.94 
 
 		 705 aa  551  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.1 
 
 		 780 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  41.45 
 
 		 725 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.52 
 
 		 781 aa  544  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.84 
 
 		 802 aa  544  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41 
 
 		 775 aa  545  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  41.74 
 
 		 726 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.12 
 
 		 828 aa  541  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.85 
 
 		 784 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  40.51 
 
 		 731 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.46 
 
 		 1023 aa  538  1e-151  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.1 
 
 		 858 aa  538  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.75 
 
 		 785 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  40.43 
 
 		 724 aa  536  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  42.25 
 
 		 706 aa  538  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  38.84 
 
 		 721 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.75 
 
 		 785 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  38.02 
 
 		 807 aa  532  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  40.54 
 
 		 721 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  40.65 
 
 		 726 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.33 
 
 		 864 aa  534  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>