More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3458 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  61.67 
 
 
739 aa  927    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  57.37 
 
 
731 aa  862    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  66.71 
 
 
736 aa  1053    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  51.03 
 
 
737 aa  728    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  61.36 
 
 
742 aa  940    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  100 
 
 
762 aa  1561    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  57.33 
 
 
732 aa  865    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  62.58 
 
 
744 aa  952    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.81 
 
 
732 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  49.7 
 
 
715 aa  628  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.41 
 
 
729 aa  622  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.93 
 
 
741 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.09 
 
 
730 aa  611  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.32 
 
 
741 aa  611  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.09 
 
 
730 aa  611  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.55 
 
 
785 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.15 
 
 
729 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.27 
 
 
755 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.21 
 
 
759 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.41 
 
 
753 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.42 
 
 
711 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.43 
 
 
747 aa  602  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.17 
 
 
725 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.93 
 
 
751 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.93 
 
 
747 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  42.48 
 
 
753 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  42.41 
 
 
751 aa  596  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.8 
 
 
751 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.41 
 
 
751 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.39 
 
 
753 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.8 
 
 
747 aa  595  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.7 
 
 
756 aa  590  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.07 
 
 
831 aa  589  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.27 
 
 
765 aa  588  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.13 
 
 
757 aa  588  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.8 
 
 
773 aa  586  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.61 
 
 
751 aa  588  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.69 
 
 
766 aa  588  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.51 
 
 
802 aa  585  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.5 
 
 
754 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  43.02 
 
 
762 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.74 
 
 
751 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  42.13 
 
 
770 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  45.26 
 
 
768 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.2 
 
 
737 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.56 
 
 
858 aa  580  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  48.63 
 
 
707 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.73 
 
 
837 aa  576  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  40.57 
 
 
807 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.24 
 
 
694 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.15 
 
 
758 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.53 
 
 
830 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.83 
 
 
730 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.93 
 
 
768 aa  572  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.67 
 
 
718 aa  571  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.62 
 
 
786 aa  570  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.27 
 
 
858 aa  569  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.24 
 
 
829 aa  568  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  42.62 
 
 
892 aa  567  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  42.67 
 
 
738 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.34 
 
 
748 aa  568  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  42.28 
 
 
738 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.75 
 
 
833 aa  565  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.13 
 
 
806 aa  565  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  43.43 
 
 
751 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.37 
 
 
772 aa  564  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  40.36 
 
 
749 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.07 
 
 
781 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  47.41 
 
 
746 aa  559  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.47 
 
 
851 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.15 
 
 
738 aa  558  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  42.06 
 
 
770 aa  556  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  42.47 
 
 
759 aa  556  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  43.86 
 
 
706 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  40.42 
 
 
757 aa  554  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  40.47 
 
 
714 aa  554  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.19 
 
 
763 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.03 
 
 
775 aa  555  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.4 
 
 
762 aa  549  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  41.85 
 
 
779 aa  552  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.03 
 
 
838 aa  551  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.11 
 
 
784 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.88 
 
 
781 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.97 
 
 
817 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.32 
 
 
780 aa  547  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  42.39 
 
 
726 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.53 
 
 
795 aa  547  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.25 
 
 
797 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.05 
 
 
828 aa  545  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  46.65 
 
 
678 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  42.6 
 
 
771 aa  545  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  40.76 
 
 
760 aa  542  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.8 
 
 
785 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  40.85 
 
 
783 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.8 
 
 
785 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.38 
 
 
765 aa  541  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.33 
 
 
857 aa  539  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  40.54 
 
 
804 aa  541  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  47.08 
 
 
797 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  41.17 
 
 
798 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.970559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>