More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4114 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  66.84 
 
 
776 aa  1092    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  75.8 
 
 
772 aa  1240    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  54.96 
 
 
805 aa  875    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  68.18 
 
 
772 aa  1116    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03301  UvrD/REP helicase  51.12 
 
 
809 aa  804    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.479147  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  55.26 
 
 
798 aa  876    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0178  ATP-dependent DNA helicase Rep  55.13 
 
 
796 aa  873    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.349073  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  54.68 
 
 
805 aa  875    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0306  ATP-dependent DNA helicase Rep  50.25 
 
 
802 aa  777    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  59.6 
 
 
794 aa  998    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25591  UvrD/REP helicase  53.95 
 
 
802 aa  827    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  99.87 
 
 
781 aa  1608    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03281  UvrD/REP helicase  50.51 
 
 
802 aa  769    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03371  UvrD/REP helicase  50.12 
 
 
802 aa  766    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4232  ATP-dependent DNA helicase Rep  65.21 
 
 
781 aa  1041    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491131  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  61.68 
 
 
797 aa  1003    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  100 
 
 
781 aa  1609    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03271  UvrD/REP helicase  50.44 
 
 
802 aa  777    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.56 
 
 
732 aa  588  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.33 
 
 
715 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.7 
 
 
741 aa  581  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.25 
 
 
729 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.73 
 
 
741 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.65 
 
 
725 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.17 
 
 
747 aa  559  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.57 
 
 
785 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.82 
 
 
730 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.95 
 
 
753 aa  558  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.3 
 
 
751 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  39.95 
 
 
753 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  40.05 
 
 
751 aa  555  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.3 
 
 
747 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.05 
 
 
751 aa  555  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.47 
 
 
730 aa  553  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.05 
 
 
751 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.78 
 
 
747 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.47 
 
 
730 aa  553  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.6 
 
 
755 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.92 
 
 
718 aa  553  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.8 
 
 
753 aa  551  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  40.08 
 
 
707 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.08 
 
 
729 aa  551  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  40.41 
 
 
731 aa  549  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.21 
 
 
711 aa  549  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.1 
 
 
737 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  40.3 
 
 
757 aa  548  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  39.9 
 
 
739 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.26 
 
 
759 aa  543  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.25 
 
 
831 aa  544  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.05 
 
 
766 aa  538  1e-151  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.84 
 
 
786 aa  538  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.47 
 
 
757 aa  535  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  39.34 
 
 
736 aa  535  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41 
 
 
694 aa  535  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  39.13 
 
 
770 aa  530  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.4 
 
 
773 aa  528  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  38.88 
 
 
768 aa  526  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.5 
 
 
754 aa  525  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.43 
 
 
806 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.04 
 
 
763 aa  523  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.85 
 
 
768 aa  525  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.8 
 
 
742 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  37.52 
 
 
762 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.94 
 
 
751 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.98 
 
 
748 aa  520  1e-146  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  39.67 
 
 
738 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.82 
 
 
751 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.22 
 
 
738 aa  513  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.61 
 
 
756 aa  512  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  38.97 
 
 
746 aa  512  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  40.57 
 
 
705 aa  514  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  38.12 
 
 
744 aa  515  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.68 
 
 
851 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.47 
 
 
765 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  39.26 
 
 
738 aa  512  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.23 
 
 
858 aa  507  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.64 
 
 
795 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.17 
 
 
781 aa  505  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  38.1 
 
 
759 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.44 
 
 
858 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  38.45 
 
 
741 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.37 
 
 
781 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  40.84 
 
 
807 aa  501  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.11 
 
 
758 aa  499  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  39.24 
 
 
742 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.19 
 
 
794 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  39.36 
 
 
678 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.94 
 
 
838 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.52 
 
 
797 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.43 
 
 
829 aa  492  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  38.31 
 
 
771 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  37.87 
 
 
737 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  39.39 
 
 
706 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.62 
 
 
857 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.93 
 
 
780 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  37.32 
 
 
758 aa  492  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  37.94 
 
 
725 aa  490  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  38.34 
 
 
741 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  38.33 
 
 
728 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  38.33 
 
 
728 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.658271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>