More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2021 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  86.95 
 
 
725 aa  1239    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  86.95 
 
 
726 aa  1228    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  85.99 
 
 
726 aa  1242    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  100 
 
 
745 aa  1499    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  44.89 
 
 
669 aa  551  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  41.95 
 
 
655 aa  493  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  42.48 
 
 
668 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  40.35 
 
 
681 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  38.29 
 
 
754 aa  433  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  38.07 
 
 
656 aa  418  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  38.7 
 
 
714 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  37.33 
 
 
648 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  37.33 
 
 
648 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  35.18 
 
 
706 aa  406  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  40.06 
 
 
702 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  39.41 
 
 
717 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  41.17 
 
 
725 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  41.37 
 
 
702 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  35.33 
 
 
630 aa  396  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  38.85 
 
 
700 aa  395  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2743  UvrD/REP helicase  40.31 
 
 
688 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  40.06 
 
 
687 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  39.12 
 
 
708 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  38.51 
 
 
689 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3335  UvrD/REP helicase  39.22 
 
 
694 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.667259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  38.68 
 
 
750 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  39.82 
 
 
719 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.08 
 
 
686 aa  379  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  38.11 
 
 
686 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  38.95 
 
 
720 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  38.4 
 
 
689 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2469  UvrD/REP helicase  38.62 
 
 
724 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5744  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0548  UvrD/REP helicase  40.66 
 
 
745 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  38.51 
 
 
712 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  39.22 
 
 
685 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  35.36 
 
 
742 aa  369  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0230  UvrD/REP helicase  39.34 
 
 
686 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05321  ATP-dependent DNA helicase II protein  36.77 
 
 
710 aa  359  8e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314896  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4129  UvrD/REP helicase  36.87 
 
 
716 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  36.99 
 
 
768 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4241  UvrD/REP helicase  36.87 
 
 
716 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.76 
 
 
719 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  38.95 
 
 
687 aa  356  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  38.15 
 
 
707 aa  353  8e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  39.63 
 
 
676 aa  353  8e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  33.97 
 
 
733 aa  349  8e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37 
 
 
729 aa  346  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  36.68 
 
 
736 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  32.68 
 
 
773 aa  339  9e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  34.38 
 
 
755 aa  337  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  33.66 
 
 
749 aa  336  9e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1967  UvrD/REP helicase  36.12 
 
 
789 aa  336  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  33.47 
 
 
789 aa  335  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  31.97 
 
 
769 aa  333  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  34.06 
 
 
764 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.39 
 
 
694 aa  332  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.11 
 
 
755 aa  331  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.19 
 
 
741 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  33.39 
 
 
735 aa  328  3e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  32.24 
 
 
779 aa  326  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.47 
 
 
730 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  37.14 
 
 
739 aa  324  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  37.13 
 
 
768 aa  323  7e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.21 
 
 
737 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  34.6 
 
 
783 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  33.75 
 
 
724 aa  321  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  37.42 
 
 
741 aa  321  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  36.61 
 
 
746 aa  320  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 
666 aa  319  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  33.38 
 
 
625 aa  319  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  37.63 
 
 
659 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.78 
 
 
732 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  34.98 
 
 
762 aa  317  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.08 
 
 
748 aa  317  5e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.73 
 
 
715 aa  317  6e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.55 
 
 
768 aa  317  8e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.03 
 
 
772 aa  315  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.08 
 
 
741 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.38 
 
 
831 aa  315  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  31.93 
 
 
757 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.72 
 
 
773 aa  315  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.13 
 
 
763 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  34.72 
 
 
726 aa  313  9e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.39 
 
 
765 aa  312  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  34.97 
 
 
762 aa  313  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.06 
 
 
754 aa  311  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.28 
 
 
742 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.14 
 
 
718 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  34.03 
 
 
765 aa  311  4e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  33.88 
 
 
778 aa  311  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.76 
 
 
785 aa  310  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.65 
 
 
781 aa  310  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  35.47 
 
 
705 aa  310  5e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.87 
 
 
711 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.76 
 
 
753 aa  310  8e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.87 
 
 
753 aa  310  9e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  32.16 
 
 
639 aa  310  9e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.92 
 
 
751 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  32.92 
 
 
753 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.92 
 
 
747 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>