More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1532 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  54.14 
 
 		 630 aa  659    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 648 aa  1316    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  52.7 
 
 		 656 aa  667    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 648 aa  1316    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  51.39 
 
 		 706 aa  632  1e-180  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  41.22 
 
 		 669 aa  468  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  42.23 
 
 		 655 aa  462  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  39.45 
 
 		 726 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  39.45 
 
 		 725 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  39.45 
 
 		 726 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  37.84 
 
 		 668 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  37.33 
 
 		 745 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  36.56 
 
 		 681 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.64 
 
 		 719 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  36.75 
 
 		 714 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  36.66 
 
 		 754 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  35.52 
 
 		 719 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.37 
 
 		 686 aa  362  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  35.89 
 
 		 687 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  35.64 
 
 		 702 aa  350  4e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  35.65 
 
 		 717 aa  350  4e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  36.03 
 
 		 686 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  36.59 
 
 		 768 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  35.21 
 
 		 689 aa  346  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  34.73 
 
 		 689 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2743  UvrD/REP helicase  35.81 
 
 		 688 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  36.11 
 
 		 708 aa  340  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  36.13 
 
 		 720 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  35.52 
 
 		 750 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  34.87 
 
 		 700 aa  336  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  35.77 
 
 		 746 aa  333  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0230  UvrD/REP helicase  35.14 
 
 		 686 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3335  UvrD/REP helicase  34.03 
 
 		 694 aa  332  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.667259 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  33.03 
 
 		 733 aa  331  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  33.44 
 
 		 742 aa  332  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  35.48 
 
 		 685 aa  332  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  34.71 
 
 		 712 aa  330  7e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  35.01 
 
 		 702 aa  329  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  34.34 
 
 		 725 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1967  UvrD/REP helicase  34.72 
 
 		 789 aa  326  9e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  33.23 
 
 		 749 aa  325  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  34.5 
 
 		 687 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4241  UvrD/REP helicase  33.19 
 
 		 716 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4129  UvrD/REP helicase  33.19 
 
 		 716 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_003296  RS05321  ATP-dependent DNA helicase II protein  32.49 
 
 		 710 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2469  UvrD/REP helicase  36.51 
 
 		 724 aa  320  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.13 
 
 		 694 aa  321  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0548  UvrD/REP helicase  33.24 
 
 		 745 aa  320  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254513  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.23 
 
 		 785 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  33.03 
 
 		 714 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  33.08 
 
 		 765 aa  317  4e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  33.65 
 
 		 726 aa  313  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.82 
 
 		 732 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  33.66 
 
 		 707 aa  309  9e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  33.03 
 
 		 731 aa  309  9e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  34.95 
 
 		 625 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  31.72 
 
 		 721 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  31.57 
 
 		 721 aa  306  7e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.7 
 
 		 755 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  33.07 
 
 		 738 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  32.23 
 
 		 705 aa  303  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.59 
 
 		 738 aa  302  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  31.18 
 
 		 773 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  32.59 
 
 		 738 aa  302  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.47 
 
 		 753 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  32.77 
 
 		 768 aa  300  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  32.35 
 
 		 689 aa  300  4e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  33.44 
 
 		 757 aa  300  6e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 764 aa  299  8e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.07 
 
 		 751 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.07 
 
 		 747 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  31.56 
 
 		 814 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.37 
 
 		 747 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  32.26 
 
 		 696 aa  298  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  30.95 
 
 		 759 aa  298  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  32.79 
 
 		 762 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.32 
 
 		 753 aa  298  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  32.07 
 
 		 753 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.07 
 
 		 751 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.07 
 
 		 747 aa  297  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  32.07 
 
 		 751 aa  297  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.07 
 
 		 751 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  31.44 
 
 		 778 aa  297  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  31.2 
 
 		 735 aa  296  8e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  31.28 
 
 		 724 aa  296  9e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.12 
 
 		 725 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.58 
 
 		 742 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.54 
 
 		 713 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  33.28 
 
 		 755 aa  294  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.67 
 
 		 741 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  31.02 
 
 		 751 aa  293  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  33.08 
 
 		 706 aa  293  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  34.21 
 
 		 725 aa  293  9e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  32.01 
 
 		 742 aa  292  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.13 
 
 		 788 aa  292  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  32.92 
 
 		 676 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  31.36 
 
 		 724 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.51 
 
 		 689 aa  291  2e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.82 
 
 		 763 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  33.08 
 
 		 781 aa  291  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>