More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0745 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 655 aa  1317    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  43.1 
 
 		 726 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  43.1 
 
 		 725 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  42.95 
 
 		 726 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  41.95 
 
 		 745 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  42.23 
 
 		 648 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  42.23 
 
 		 648 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  39.14 
 
 		 669 aa  453  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  39.97 
 
 		 656 aa  450  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  38.45 
 
 		 706 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  36.79 
 
 		 668 aa  419  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  38.7 
 
 		 754 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  38.08 
 
 		 681 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  39.27 
 
 		 700 aa  403  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  38.45 
 
 		 630 aa  402  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  38.94 
 
 		 702 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3335  UvrD/REP helicase  37.77 
 
 		 694 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.667259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2743  UvrD/REP helicase  38.06 
 
 		 688 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  37.1 
 
 		 687 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  37.71 
 
 		 689 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.17 
 
 		 686 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  38.32 
 
 		 719 aa  392  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  37.01 
 
 		 714 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  37.17 
 
 		 686 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  36.87 
 
 		 708 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0230  UvrD/REP helicase  36.27 
 
 		 686 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  36.8 
 
 		 720 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  37.58 
 
 		 689 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  36.11 
 
 		 685 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  37.68 
 
 		 725 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  36.32 
 
 		 717 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  35.68 
 
 		 712 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  35.77 
 
 		 750 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.3 
 
 		 719 aa  372  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0548  UvrD/REP helicase  36.76 
 
 		 745 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254513  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05321  ATP-dependent DNA helicase II protein  35.01 
 
 		 710 aa  369  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  35.53 
 
 		 687 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  36.19 
 
 		 702 aa  365  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4241  UvrD/REP helicase  35.75 
 
 		 716 aa  361  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4129  UvrD/REP helicase  35.75 
 
 		 716 aa  361  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  35.31 
 
 		 768 aa  356  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1967  UvrD/REP helicase  36.35 
 
 		 789 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  35.34 
 
 		 733 aa  345  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  35.85 
 
 		 707 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  34.63 
 
 		 742 aa  339  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  34.48 
 
 		 705 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  34.95 
 
 		 724 aa  331  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  35.8 
 
 		 731 aa  325  1e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.7 
 
 		 729 aa  322  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  34.55 
 
 		 749 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  34.95 
 
 		 625 aa  320  6e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  33 
 
 		 676 aa  320  6e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  34.95 
 
 		 735 aa  320  7e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  34.99 
 
 		 714 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  34.88 
 
 		 768 aa  317  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.24 
 
 		 732 aa  318  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  33.28 
 
 		 769 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  34.25 
 
 		 731 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2469  UvrD/REP helicase  35.42 
 
 		 724 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.64 
 
 		 737 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.39 
 
 		 730 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.39 
 
 		 730 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.39 
 
 		 741 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  32.69 
 
 		 757 aa  311  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.9 
 
 		 892 aa  310  8e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.28 
 
 		 713 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.92 
 
 		 718 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 		 688 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.66 
 
 		 785 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  34.25 
 
 		 778 aa  307  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  32.47 
 
 		 760 aa  307  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  33.18 
 
 		 790 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  32.57 
 
 		 728 aa  306  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  34.48 
 
 		 755 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  35.53 
 
 		 735 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.02 
 
 		 729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  34.06 
 
 		 764 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  34.76 
 
 		 706 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.56 
 
 		 745 aa  304  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  32.29 
 
 		 737 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.41 
 
 		 726 aa  303  6.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  32.1 
 
 		 741 aa  303  7.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  32.67 
 
 		 804 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  34.2 
 
 		 725 aa  302  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  32.21 
 
 		 739 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  32.55 
 
 		 817 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  31.28 
 
 		 783 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.85 
 
 		 755 aa  301  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.12 
 
 		 639 aa  300  6e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  31.78 
 
 		 706 aa  300  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  34.15 
 
 		 783 aa  300  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  33.85 
 
 		 746 aa  300  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  31.73 
 
 		 787 aa  300  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.33 
 
 		 747 aa  300  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  31.28 
 
 		 639 aa  300  8e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.46 
 
 		 725 aa  299  9e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 753 aa  299  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 751 aa  299  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.33 
 
 		 751 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  33.18 
 
 		 773 aa  299  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>