More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0794 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  49.66 
 
 
768 aa  697    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  68.77 
 
 
735 aa  1035    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  67.29 
 
 
743 aa  1001    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  70.18 
 
 
739 aa  1040    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  69.14 
 
 
741 aa  1041    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  100 
 
 
735 aa  1510    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  76.42 
 
 
743 aa  1140    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  69.45 
 
 
734 aa  1041    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  43.85 
 
 
749 aa  599  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  42.84 
 
 
757 aa  598  1e-169  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  44.96 
 
 
707 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  43.02 
 
 
764 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.86 
 
 
755 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  41.58 
 
 
769 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.35 
 
 
751 aa  568  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.2 
 
 
751 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.76 
 
 
732 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.72 
 
 
737 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  40.7 
 
 
773 aa  555  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  41.17 
 
 
755 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.2 
 
 
741 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.57 
 
 
730 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  41.58 
 
 
783 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.57 
 
 
730 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.17 
 
 
711 aa  545  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.14 
 
 
718 aa  546  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.8 
 
 
729 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  40.82 
 
 
789 aa  548  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.94 
 
 
747 aa  545  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  40.54 
 
 
778 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.77 
 
 
730 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.67 
 
 
741 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.09 
 
 
715 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.59 
 
 
751 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  41.48 
 
 
753 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  41.72 
 
 
751 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.72 
 
 
751 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.59 
 
 
751 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.53 
 
 
742 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.59 
 
 
747 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.05 
 
 
725 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.74 
 
 
753 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.34 
 
 
753 aa  538  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.78 
 
 
756 aa  538  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.84 
 
 
729 aa  535  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.2 
 
 
785 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  40.85 
 
 
744 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.26 
 
 
747 aa  535  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  40.64 
 
 
739 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  41.15 
 
 
765 aa  530  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  41.5 
 
 
757 aa  528  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.65 
 
 
766 aa  527  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  39.73 
 
 
736 aa  525  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  41.92 
 
 
731 aa  525  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.87 
 
 
806 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.01 
 
 
831 aa  519  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.29 
 
 
786 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.56 
 
 
773 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.34 
 
 
772 aa  516  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.92 
 
 
759 aa  512  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  40.42 
 
 
759 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  39.76 
 
 
737 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  40.29 
 
 
751 aa  515  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.52 
 
 
748 aa  513  1e-144  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  39.49 
 
 
762 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  38.98 
 
 
738 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  39.4 
 
 
762 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.98 
 
 
738 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  39.24 
 
 
727 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.47 
 
 
795 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  40.11 
 
 
728 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  39.97 
 
 
728 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  40 
 
 
728 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  39.81 
 
 
727 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  38.77 
 
 
738 aa  503  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  39.21 
 
 
728 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  40.84 
 
 
714 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.23 
 
 
757 aa  502  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  39.07 
 
 
812 aa  499  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  40.13 
 
 
742 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  40.71 
 
 
696 aa  501  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  39.75 
 
 
729 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.71 
 
 
758 aa  501  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  39.73 
 
 
728 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.87 
 
 
781 aa  497  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  40.05 
 
 
786 aa  496  1e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.91 
 
 
794 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.13 
 
 
763 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  38.44 
 
 
726 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.77 
 
 
829 aa  495  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.48 
 
 
802 aa  492  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  38.82 
 
 
727 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.71 
 
 
754 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.61 
 
 
837 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  38.68 
 
 
770 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.89 
 
 
830 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  38.6 
 
 
706 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.81 
 
 
765 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  39.71 
 
 
741 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.16 
 
 
817 aa  491  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>