More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2335 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  100 
 
 		 745 aa  1535    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  36.28 
 
 		 728 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  37.48 
 
 		 744 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  36.86 
 
 		 707 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.65 
 
 		 729 aa  438  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.77 
 
 		 732 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.33 
 
 		 795 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.74 
 
 		 755 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.45 
 
 		 892 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  38.62 
 
 		 762 aa  432  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  36.26 
 
 		 739 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.5 
 
 		 763 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.96 
 
 		 758 aa  428  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.46 
 
 		 794 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.43 
 
 		 742 aa  425  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.88 
 
 		 718 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  38.63 
 
 		 816 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  36.75 
 
 		 736 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.03 
 
 		 831 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.7 
 
 		 730 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.7 
 
 		 730 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2436  UvrD/REP helicase  36.12 
 
 		 778 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0016628  normal  0.650689 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  35.65 
 
 		 726 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  38.48 
 
 		 638 aa  416  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.07 
 
 		 765 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  35.74 
 
 		 760 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.23 
 
 		 754 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  35.01 
 
 		 735 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  38.62 
 
 		 817 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.51 
 
 		 715 aa  419  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  38.74 
 
 		 714 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  37.58 
 
 		 735 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  36.61 
 
 		 706 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  35.98 
 
 		 757 aa  418  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  35.69 
 
 		 726 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.2 
 
 		 762 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  35.78 
 
 		 705 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.84 
 
 		 741 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.85 
 
 		 753 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  35.79 
 
 		 737 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  35.53 
 
 		 743 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  38.42 
 
 		 790 aa  415  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.3 
 
 		 781 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.91 
 
 		 741 aa  412  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.18 
 
 		 729 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.56 
 
 		 747 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  39.12 
 
 		 789 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.77 
 
 		 751 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.9 
 
 		 751 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  35.77 
 
 		 751 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.1 
 
 		 753 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  38.01 
 
 		 798 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.78 
 
 		 785 aa  412  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.9 
 
 		 747 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.48 
 
 		 768 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  38.29 
 
 		 795 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.06 
 
 		 806 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  40.22 
 
 		 698 aa  409  1e-113  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.42 
 
 		 773 aa  412  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  38.29 
 
 		 795 aa  412  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.3 
 
 		 747 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.19 
 
 		 759 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  35.68 
 
 		 753 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.79 
 
 		 713 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  34.91 
 
 		 721 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  36.79 
 
 		 804 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.77 
 
 		 751 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  38.86 
 
 		 800 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2037  UvrD/REP helicase  36.25 
 
 		 850 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114912  normal  0.635195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.65 
 
 		 876 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.96 
 
 		 751 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.81 
 
 		 772 aa  407  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  37.19 
 
 		 858 aa  409  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.87 
 
 		 763 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  38.53 
 
 		 825 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  34.9 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  34.9 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  35.35 
 
 		 726 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  34.9 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  34.9 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  34.9 
 
 		 741 aa  402  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  35.44 
 
 		 728 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  34.9 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  35.32 
 
 		 724 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  35.22 
 
 		 709 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  34.9 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  35.22 
 
 		 709 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  34.93 
 
 		 723 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  34.87 
 
 		 741 aa  405  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  34.9 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  34.9 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  38.66 
 
 		 678 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  35.02 
 
 		 720 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.09 
 
 		 751 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  36.1 
 
 		 779 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  34.54 
 
 		 721 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  34.9 
 
 		 720 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  35.02 
 
 		 720 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  37.81 
 
 		 816 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  34.65 
 
 		 833 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>