More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0254 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  65.7 
 
 		 733 aa  1010    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 742 aa  1531    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  41.31 
 
 		 754 aa  527  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  35.37 
 
 		 681 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  36.39 
 
 		 714 aa  399  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  36.19 
 
 		 669 aa  397  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  36.35 
 
 		 719 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1967  UvrD/REP helicase  36.07 
 
 		 789 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2469  UvrD/REP helicase  37.62 
 
 		 724 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.58 
 
 		 719 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  36.54 
 
 		 700 aa  375  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  35.57 
 
 		 702 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  35.36 
 
 		 745 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  36.29 
 
 		 656 aa  366  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  36.26 
 
 		 726 aa  360  7e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  36.26 
 
 		 726 aa  359  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  34.93 
 
 		 668 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  35.8 
 
 		 725 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  35.52 
 
 		 768 aa  355  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  36.49 
 
 		 687 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.85 
 
 		 686 aa  347  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  35.39 
 
 		 725 aa  346  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.8 
 
 		 741 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05321  ATP-dependent DNA helicase II protein  34.27 
 
 		 710 aa  343  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  35.5 
 
 		 686 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  35.51 
 
 		 702 aa  342  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.09 
 
 		 747 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  34.63 
 
 		 655 aa  339  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  36.09 
 
 		 753 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  36.09 
 
 		 751 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.67 
 
 		 729 aa  338  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.09 
 
 		 751 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.09 
 
 		 751 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0548  UvrD/REP helicase  34.53 
 
 		 745 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.09 
 
 		 751 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.09 
 
 		 747 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  35.23 
 
 		 689 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.66 
 
 		 753 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  34.76 
 
 		 687 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  34.69 
 
 		 712 aa  335  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  34.28 
 
 		 717 aa  335  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.61 
 
 		 753 aa  335  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.76 
 
 		 747 aa  334  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  34.22 
 
 		 779 aa  334  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3335  UvrD/REP helicase  34.43 
 
 		 694 aa  334  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.667259 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  35.38 
 
 		 720 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  33.44 
 
 		 648 aa  332  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  33.44 
 
 		 648 aa  332  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2743  UvrD/REP helicase  34.87 
 
 		 688 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  34.9 
 
 		 735 aa  329  9e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  34.56 
 
 		 742 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  31.53 
 
 		 676 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.93 
 
 		 751 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4129  UvrD/REP helicase  34.47 
 
 		 716 aa  328  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4241  UvrD/REP helicase  34.47 
 
 		 716 aa  328  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.63 
 
 		 751 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.36 
 
 		 755 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  35.06 
 
 		 708 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  35.49 
 
 		 768 aa  325  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.22 
 
 		 757 aa  325  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.35 
 
 		 732 aa  323  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  33.87 
 
 		 630 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.19 
 
 		 763 aa  320  6e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.07 
 
 		 711 aa  320  7e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  34.38 
 
 		 705 aa  320  7.999999999999999e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.78 
 
 		 785 aa  319  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  33.13 
 
 		 706 aa  318  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  34.24 
 
 		 750 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  34.58 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.56 
 
 		 754 aa  317  4e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.22 
 
 		 715 aa  317  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.24 
 
 		 768 aa  317  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0230  UvrD/REP helicase  34.02 
 
 		 686 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.95 
 
 		 781 aa  315  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  34.92 
 
 		 731 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  32.21 
 
 		 707 aa  315  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  33.96 
 
 		 685 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  33.92 
 
 		 724 aa  312  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  33.58 
 
 		 706 aa  312  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  32.8 
 
 		 769 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.38 
 
 		 759 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  34.56 
 
 		 762 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.43 
 
 		 851 aa  308  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.08 
 
 		 762 aa  306  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.01 
 
 		 756 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  33.53 
 
 		 757 aa  305  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.96 
 
 		 831 aa  303  5.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  33.93 
 
 		 789 aa  303  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.99 
 
 		 802 aa  303  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.8 
 
 		 892 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  33.9 
 
 		 765 aa  303  7.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  32.39 
 
 		 845 aa  303  7.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  33.12 
 
 		 638 aa  303  9e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.23 
 
 		 729 aa  303  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.73 
 
 		 829 aa  303  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  33.89 
 
 		 741 aa  302  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  34.39 
 
 		 749 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.15 
 
 		 772 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  33.04 
 
 		 771 aa  301  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.24 
 
 		 775 aa  300  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>