More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0860 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  64.11 
 
 		 638 aa  858    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  94.05 
 
 		 639 aa  1257    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  100 
 
 		 639 aa  1316    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  47.6 
 
 		 804 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  48.51 
 
 		 728 aa  633  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  48.91 
 
 		 790 aa  631  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  49.37 
 
 		 760 aa  628  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.26 
 
 		 763 aa  617  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  47.51 
 
 		 892 aa  617  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2436  UvrD/REP helicase  47.89 
 
 		 778 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0016628  normal  0.650689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2483  DNA helicase II  48.23 
 
 		 807 aa  613  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  47.24 
 
 		 817 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  48.61 
 
 		 816 aa  610  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  49.68 
 
 		 630 aa  608  9.999999999999999e-173  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.64 
 
 		 768 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  45.88 
 
 		 783 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.54 
 
 		 817 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.02 
 
 		 814 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  47.97 
 
 		 800 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.72 
 
 		 783 aa  601  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  47.74 
 
 		 825 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  45.72 
 
 		 786 aa  601  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.58 
 
 		 765 aa  597  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  46.17 
 
 		 858 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  47.28 
 
 		 826 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  46.33 
 
 		 816 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  44.85 
 
 		 816 aa  590  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2037  UvrD/REP helicase  44.82 
 
 		 850 aa  591  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114912  normal  0.635195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  45.87 
 
 		 795 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  46.02 
 
 		 795 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3367  UvrD/REP helicase  43.68 
 
 		 847 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  46.49 
 
 		 797 aa  588  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  46.69 
 
 		 799 aa  588  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  46.18 
 
 		 798 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  43.72 
 
 		 833 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  47.09 
 
 		 770 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  46.42 
 
 		 789 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4021  UvrD/REP helicase  43.21 
 
 		 848 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2023  UvrD/REP helicase  43.27 
 
 		 845 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6141  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.17 
 
 		 855 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.54 
 
 		 876 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1413  DNA helicase II  43.66 
 
 		 858 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338777  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1764  UvrD/REP helicase  43.42 
 
 		 864 aa  568  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1369  DNA helicase II  43.36 
 
 		 858 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.65 
 
 		 673 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.44 
 
 		 715 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.06 
 
 		 732 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.32 
 
 		 785 aa  502  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.15 
 
 		 737 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  40.1 
 
 		 744 aa  485  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.53 
 
 		 753 aa  486  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  40.53 
 
 		 726 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  40.75 
 
 		 720 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  40.75 
 
 		 720 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  39.47 
 
 		 726 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.53 
 
 		 747 aa  485  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.65 
 
 		 751 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  40.65 
 
 		 753 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  40.65 
 
 		 751 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.62 
 
 		 747 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.65 
 
 		 747 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  40.75 
 
 		 720 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  39.66 
 
 		 721 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  39.88 
 
 		 726 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.65 
 
 		 751 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.37 
 
 		 753 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  40.75 
 
 		 720 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.65 
 
 		 751 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  40 
 
 		 728 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  40.75 
 
 		 720 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  40 
 
 		 728 aa  485  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  40.47 
 
 		 768 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  39.04 
 
 		 721 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  40.22 
 
 		 721 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  40.59 
 
 		 720 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  40.59 
 
 		 720 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  40.59 
 
 		 720 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  40.43 
 
 		 723 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  40.59 
 
 		 720 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  40.59 
 
 		 720 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  38.9 
 
 		 735 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  40.59 
 
 		 720 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  40.75 
 
 		 720 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.34 
 
 		 741 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  40.59 
 
 		 720 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  38.54 
 
 		 725 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  39.5 
 
 		 721 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  40.59 
 
 		 720 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  39.69 
 
 		 736 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  39.5 
 
 		 722 aa  478  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  38.15 
 
 		 709 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  39.35 
 
 		 721 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  39.35 
 
 		 721 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  38.15 
 
 		 709 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  38.35 
 
 		 737 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  40.12 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  39.5 
 
 		 722 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40 
 
 		 759 aa  474  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  38.98 
 
 		 727 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  39.81 
 
 		 722 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>