More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0381 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 688 aa  1395    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  45.13 
 
 		 678 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  45.4 
 
 		 678 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  44.56 
 
 		 678 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  47.15 
 
 		 671 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  47.48 
 
 		 682 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  47.25 
 
 		 671 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  47.1 
 
 		 671 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  42.4 
 
 		 678 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  42.29 
 
 		 678 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  44.23 
 
 		 672 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  45.04 
 
 		 665 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.48 
 
 		 741 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  43.48 
 
 		 736 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.73 
 
 		 742 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.97 
 
 		 785 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.1 
 
 		 732 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.39 
 
 		 725 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.14 
 
 		 753 aa  502  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  44.28 
 
 		 744 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.14 
 
 		 753 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.3 
 
 		 751 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.3 
 
 		 747 aa  501  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.3 
 
 		 751 aa  502  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  42.3 
 
 		 753 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  42.3 
 
 		 751 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.3 
 
 		 747 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.3 
 
 		 747 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.75 
 
 		 730 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.3 
 
 		 751 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.75 
 
 		 730 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.58 
 
 		 759 aa  498  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.59 
 
 		 755 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  44.39 
 
 		 739 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  41.29 
 
 		 770 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  43.87 
 
 		 762 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.99 
 
 		 715 aa  491  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41 
 
 		 757 aa  489  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  45.32 
 
 		 707 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.94 
 
 		 751 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.78 
 
 		 772 aa  485  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.18 
 
 		 729 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.69 
 
 		 781 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.3 
 
 		 694 aa  482  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.79 
 
 		 751 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  42.38 
 
 		 696 aa  485  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  44.21 
 
 		 768 aa  482  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.28 
 
 		 730 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.66 
 
 		 741 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.03 
 
 		 671 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  41.37 
 
 		 737 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.05 
 
 		 729 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.49 
 
 		 756 aa  482  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  39.64 
 
 		 666 aa  479  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.41 
 
 		 662 aa  477  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  41.02 
 
 		 783 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  40.61 
 
 		 749 aa  478  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  42.5 
 
 		 779 aa  478  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.16 
 
 		 711 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.62 
 
 		 670 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  41.82 
 
 		 663 aa  472  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3266  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.04 
 
 		 670 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.19 
 
 		 718 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  41.68 
 
 		 759 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.5 
 
 		 786 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  41.02 
 
 		 789 aa  471  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.5 
 
 		 737 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.23 
 
 		 672 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  40.41 
 
 		 672 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  40.2 
 
 		 764 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  42.41 
 
 		 751 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0428  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.19 
 
 		 670 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12866  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4325  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.34 
 
 		 671 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.6 
 
 		 765 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  43.5 
 
 		 706 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3990  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.36 
 
 		 670 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  38.71 
 
 		 757 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  40.75 
 
 		 738 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.79 
 
 		 806 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0305  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.48 
 
 		 670 aa  465  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  42.3 
 
 		 732 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.75 
 
 		 738 aa  465  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  39.73 
 
 		 731 aa  463  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3913  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.06 
 
 		 670 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  41.51 
 
 		 762 aa  465  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4012  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.06 
 
 		 670 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.75 
 
 		 662 aa  465  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  40.22 
 
 		 677 aa  463  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.3 
 
 		 658 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  41.68 
 
 		 671 aa  464  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  42.75 
 
 		 662 aa  465  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0070  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.39 
 
 		 671 aa  465  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0376  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.05 
 
 		 671 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.158989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3650  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.05 
 
 		 671 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.06 
 
 		 685 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.52 
 
 		 795 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.21 
 
 		 671 aa  463  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0374  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.19 
 
 		 671 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.91 
 
 		 669 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  39.7 
 
 		 773 aa  460  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>