More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2069 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  57.5 
 
 
678 aa  796    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  51.41 
 
 
678 aa  686    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  59.02 
 
 
678 aa  803    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  57.06 
 
 
678 aa  796    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  100 
 
 
665 aa  1377    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  63.61 
 
 
672 aa  887    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  56.76 
 
 
678 aa  791    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.36 
 
 
730 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.36 
 
 
730 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.63 
 
 
730 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.43 
 
 
729 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.68 
 
 
715 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.82 
 
 
732 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.41 
 
 
785 aa  555  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.74 
 
 
741 aa  554  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.06 
 
 
741 aa  555  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.6 
 
 
753 aa  551  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.6 
 
 
747 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  45.6 
 
 
753 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  45.6 
 
 
751 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  42.24 
 
 
666 aa  549  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.6 
 
 
751 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.81 
 
 
718 aa  551  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.6 
 
 
751 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.6 
 
 
753 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.58 
 
 
725 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.44 
 
 
751 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.44 
 
 
747 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.29 
 
 
747 aa  548  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.75 
 
 
729 aa  544  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.67 
 
 
737 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.04 
 
 
755 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  45.78 
 
 
739 aa  535  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  45.04 
 
 
688 aa  532  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.47 
 
 
742 aa  535  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  43.06 
 
 
757 aa  534  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  45.09 
 
 
707 aa  529  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.28 
 
 
694 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  45.31 
 
 
736 aa  525  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  43.75 
 
 
768 aa  524  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  45.73 
 
 
662 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  46.07 
 
 
807 aa  520  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  43.97 
 
 
744 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.85 
 
 
831 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.22 
 
 
757 aa  521  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.73 
 
 
662 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.65 
 
 
711 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.67 
 
 
806 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.78 
 
 
858 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  45.37 
 
 
731 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  44.76 
 
 
705 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.66 
 
 
751 aa  510  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.81 
 
 
751 aa  510  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.52 
 
 
766 aa  510  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  45.03 
 
 
732 aa  511  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.74 
 
 
756 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  42.86 
 
 
783 aa  505  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.31 
 
 
671 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  43.77 
 
 
682 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.64 
 
 
672 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.81 
 
 
763 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  45.07 
 
 
762 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.29 
 
 
833 aa  502  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.66 
 
 
690 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.95 
 
 
829 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.11 
 
 
738 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  43.01 
 
 
668 aa  502  1e-140  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.48 
 
 
772 aa  499  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.56 
 
 
754 aa  501  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.53 
 
 
857 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.79 
 
 
838 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.37 
 
 
670 aa  499  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.32 
 
 
896 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.11 
 
 
1023 aa  499  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  41.11 
 
 
738 aa  500  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  41.95 
 
 
762 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  42.86 
 
 
671 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  43.33 
 
 
759 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  42.86 
 
 
671 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.64 
 
 
671 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.94 
 
 
758 aa  495  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  43.84 
 
 
746 aa  492  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.27 
 
 
669 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  41.76 
 
 
731 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  41.27 
 
 
669 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.16 
 
 
768 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.12 
 
 
786 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  40.34 
 
 
738 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  41.77 
 
 
677 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.76 
 
 
851 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  40.96 
 
 
749 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  42.84 
 
 
669 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.92 
 
 
858 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  42.15 
 
 
706 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.9 
 
 
663 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  43.01 
 
 
751 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  41.57 
 
 
794 aa  490  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  43.25 
 
 
770 aa  490  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.99 
 
 
830 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.66 
 
 
797 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>