More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2295 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  100 
 
 
666 aa  1366    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  45.58 
 
 
678 aa  586  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  45.36 
 
 
678 aa  581  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  45.07 
 
 
678 aa  561  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  45.21 
 
 
678 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  43.86 
 
 
672 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  44.6 
 
 
678 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.81 
 
 
715 aa  538  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  42.24 
 
 
665 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  41.57 
 
 
736 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.08 
 
 
729 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.23 
 
 
751 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.34 
 
 
755 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.27 
 
 
662 aa  514  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.77 
 
 
737 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.97 
 
 
694 aa  513  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.08 
 
 
751 aa  515  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.67 
 
 
732 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  42.38 
 
 
744 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.57 
 
 
742 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.53 
 
 
741 aa  509  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  43.21 
 
 
707 aa  509  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  41.97 
 
 
739 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.44 
 
 
711 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.97 
 
 
718 aa  502  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.01 
 
 
741 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  42.95 
 
 
768 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.06 
 
 
785 aa  505  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.87 
 
 
751 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.87 
 
 
747 aa  501  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.87 
 
 
753 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.87 
 
 
751 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  41.87 
 
 
753 aa  500  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  41.87 
 
 
751 aa  500  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  42.42 
 
 
705 aa  502  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.87 
 
 
753 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.87 
 
 
751 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.87 
 
 
747 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.79 
 
 
730 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.14 
 
 
754 aa  497  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.76 
 
 
747 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.07 
 
 
725 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.28 
 
 
757 aa  497  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  41.99 
 
 
749 aa  496  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.86 
 
 
763 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  41.9 
 
 
762 aa  495  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.81 
 
 
730 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.65 
 
 
1023 aa  492  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.81 
 
 
730 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.42 
 
 
786 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  44.38 
 
 
807 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  41.74 
 
 
696 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  41.91 
 
 
770 aa  489  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.22 
 
 
765 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.09 
 
 
806 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.69 
 
 
838 aa  487  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  40.87 
 
 
769 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  43.23 
 
 
726 aa  486  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.57 
 
 
851 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  41.77 
 
 
737 aa  482  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.94 
 
 
671 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.69 
 
 
671 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.9 
 
 
766 aa  483  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  39.64 
 
 
688 aa  479  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.09 
 
 
729 aa  481  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  41.52 
 
 
735 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  38.95 
 
 
677 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  43.21 
 
 
714 aa  481  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.61 
 
 
795 aa  481  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.94 
 
 
756 aa  481  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  40.97 
 
 
738 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  42.68 
 
 
742 aa  480  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  40.84 
 
 
773 aa  477  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  40.78 
 
 
738 aa  475  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.29 
 
 
768 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.76 
 
 
794 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.64 
 
 
762 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.48 
 
 
748 aa  479  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.73 
 
 
833 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.78 
 
 
738 aa  475  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  42.28 
 
 
732 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.97 
 
 
858 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.31 
 
 
667 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.01 
 
 
759 aa  474  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  39.14 
 
 
671 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  41.7 
 
 
724 aa  475  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  39.73 
 
 
762 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  40.52 
 
 
759 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  41.52 
 
 
789 aa  475  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  39.14 
 
 
671 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.7 
 
 
773 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  40.06 
 
 
900 aa  474  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.54 
 
 
857 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.61 
 
 
772 aa  471  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  39.43 
 
 
778 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  41.97 
 
 
731 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.91 
 
 
781 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  39.97 
 
 
755 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  42.06 
 
 
757 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  39.58 
 
 
662 aa  469  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>