More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2424 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  57.99 
 
 		 720 aa  838    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  57.99 
 
 		 720 aa  838    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  52.88 
 
 		 721 aa  779    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  56.19 
 
 		 724 aa  819    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  58.86 
 
 		 728 aa  815    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  57.99 
 
 		 720 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  57.5 
 
 		 726 aa  793    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  57.85 
 
 		 720 aa  837    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  57.99 
 
 		 720 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  46.55 
 
 		 788 aa  638    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  53.17 
 
 		 724 aa  795    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5331  UvrD/REP helicase  45.96 
 
 		 822 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  56.52 
 
 		 728 aa  769    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  54.75 
 
 		 722 aa  807    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  57.73 
 
 		 727 aa  810    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  56.46 
 
 		 720 aa  795    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  57.85 
 
 		 720 aa  838    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  58.86 
 
 		 728 aa  813    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  56.61 
 
 		 720 aa  813    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  51.86 
 
 		 721 aa  754    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  52 
 
 		 721 aa  755    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  58.18 
 
 		 727 aa  811    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  50.21 
 
 		 713 aa  684    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  54.05 
 
 		 723 aa  786    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  53.87 
 
 		 734 aa  793    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.33 
 
 		 786 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  49.73 
 
 		 726 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  46.86 
 
 		 787 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 725 aa  1459    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  57.44 
 
 		 720 aa  825    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  54.75 
 
 		 717 aa  770    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  58.96 
 
 		 727 aa  818    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  57.79 
 
 		 727 aa  800    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  46.16 
 
 		 809 aa  647    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  55.66 
 
 		 709 aa  719    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  56.34 
 
 		 723 aa  807    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  56.32 
 
 		 720 aa  793    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  57.99 
 
 		 720 aa  838    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  52.95 
 
 		 741 aa  780    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  59.14 
 
 		 729 aa  816    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  49.53 
 
 		 743 aa  664    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  52.8 
 
 		 721 aa  773    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  57.85 
 
 		 720 aa  838    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  57.9 
 
 		 735 aa  777    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  54.27 
 
 		 721 aa  798    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  48.36 
 
 		 818 aa  664    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  47.03 
 
 		 788 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  52.58 
 
 		 737 aa  772    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  58.86 
 
 		 728 aa  814    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  53.79 
 
 		 723 aa  759    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  57.85 
 
 		 720 aa  838    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  57.99 
 
 		 720 aa  838    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  54.86 
 
 		 724 aa  777    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  49.93 
 
 		 731 aa  667    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  61.26 
 
 		 721 aa  839    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.11 
 
 		 783 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  52.26 
 
 		 722 aa  770    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  57.99 
 
 		 720 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  58.25 
 
 		 739 aa  791    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  53.51 
 
 		 722 aa  792    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  56.75 
 
 		 720 aa  816    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  57.99 
 
 		 720 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  55.1 
 
 		 720 aa  771    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  56.32 
 
 		 720 aa  793    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  53.51 
 
 		 722 aa  792    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  56.19 
 
 		 724 aa  815    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  56.89 
 
 		 720 aa  825    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  54.55 
 
 		 724 aa  803    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  57.3 
 
 		 720 aa  820    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  56.33 
 
 		 723 aa  810    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  45.08 
 
 		 790 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  54.07 
 
 		 723 aa  764    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  52.47 
 
 		 726 aa  754    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  54.75 
 
 		 722 aa  805    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  54.61 
 
 		 722 aa  802    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  65.33 
 
 		 725 aa  933    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  53.29 
 
 		 727 aa  791    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  54.17 
 
 		 728 aa  750    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  54.95 
 
 		 723 aa  769    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  58.73 
 
 		 726 aa  793    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  59.3 
 
 		 728 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  59.58 
 
 		 728 aa  825    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  56.69 
 
 		 730 aa  772    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  45.73 
 
 		 783 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  53.51 
 
 		 722 aa  793    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  57.99 
 
 		 720 aa  838    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  55.66 
 
 		 709 aa  719    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  46.66 
 
 		 826 aa  650    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  54.75 
 
 		 722 aa  805    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  50.6 
 
 		 744 aa  681    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  53.92 
 
 		 722 aa  798    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  53.51 
 
 		 722 aa  791    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  47.56 
 
 		 793 aa  650    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  47.09 
 
 		 816 aa  649    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  54.13 
 
 		 721 aa  790    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  53.62 
 
 		 726 aa  793    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0008  UvrD/REP helicase  51.17 
 
 		 723 aa  721    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  57.99 
 
 		 720 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  53.91 
 
 		 726 aa  771    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  45.75 
 
 		 787 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>