More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1474 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  60.28 
 
 		 787 aa  925    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  60.15 
 
 		 786 aa  938    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  60.63 
 
 		 829 aa  946    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  60.4 
 
 		 787 aa  926    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  60.28 
 
 		 787 aa  925    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  54.99 
 
 		 713 aa  843    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  60.28 
 
 		 787 aa  925    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.76 
 
 		 786 aa  929    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  54.71 
 
 		 726 aa  780    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  71.68 
 
 		 793 aa  1123    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  60.4 
 
 		 787 aa  926    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.3 
 
 		 787 aa  932    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  77.26 
 
 		 809 aa  1233    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  75.54 
 
 		 816 aa  1183    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 781 aa  1613    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  52.55 
 
 		 743 aa  806    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  60.08 
 
 		 790 aa  938    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  60.28 
 
 		 787 aa  923    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  43.86 
 
 		 729 aa  636    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  60.86 
 
 		 783 aa  946    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  75.48 
 
 		 814 aa  1232    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  60.41 
 
 		 786 aa  939    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  55.57 
 
 		 731 aa  836    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  84.53 
 
 		 825 aa  1367    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.36 
 
 		 783 aa  939    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  60.81 
 
 		 788 aa  942    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.75 
 
 		 739 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.35 
 
 		 787 aa  954    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5331  UvrD/REP helicase  73.18 
 
 		 822 aa  1162    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  60.03 
 
 		 787 aa  932    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  60.15 
 
 		 846 aa  933    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  67 
 
 		 848 aa  1045    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  75.73 
 
 		 818 aa  1213    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  60.28 
 
 		 787 aa  925    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  60.58 
 
 		 840 aa  936    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  60.17 
 
 		 787 aa  956    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  60.58 
 
 		 787 aa  936    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  60.15 
 
 		 787 aa  934    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  60.4 
 
 		 787 aa  926    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  68.41 
 
 		 788 aa  1074    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  60.2 
 
 		 786 aa  942    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  75.67 
 
 		 826 aa  1188    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  56.25 
 
 		 744 aa  845    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  43.73 
 
 		 728 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  43.58 
 
 		 728 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  43.73 
 
 		 728 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  43.33 
 
 		 728 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  43.73 
 
 		 728 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  44.49 
 
 		 741 aa  627  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  44.14 
 
 		 730 aa  623  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  44.52 
 
 		 725 aa  624  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  44.56 
 
 		 726 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  43.07 
 
 		 727 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  45.11 
 
 		 735 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  43.47 
 
 		 721 aa  616  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  44.49 
 
 		 725 aa  615  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  44.43 
 
 		 726 aa  615  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  42.93 
 
 		 728 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  43.47 
 
 		 721 aa  615  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  43.36 
 
 		 720 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  42.2 
 
 		 727 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  41.79 
 
 		 727 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  41.38 
 
 		 723 aa  609  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  45.4 
 
 		 721 aa  611  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  41.45 
 
 		 724 aa  611  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  41.45 
 
 		 724 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  41.8 
 
 		 734 aa  605  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  43.82 
 
 		 727 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  43.11 
 
 		 720 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  42.35 
 
 		 720 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  42.35 
 
 		 720 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  42.55 
 
 		 720 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  42.35 
 
 		 720 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  42.35 
 
 		 720 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  42.5 
 
 		 728 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  42.35 
 
 		 720 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  42.35 
 
 		 720 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  42.68 
 
 		 723 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  42.35 
 
 		 720 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  42.82 
 
 		 723 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  42.35 
 
 		 720 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  41.3 
 
 		 724 aa  599  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  40.82 
 
 		 723 aa  600  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  41.32 
 
 		 737 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  42.35 
 
 		 720 aa  601  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  42.1 
 
 		 720 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  42.37 
 
 		 720 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  42.1 
 
 		 720 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  42.1 
 
 		 720 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  42.1 
 
 		 720 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  42.1 
 
 		 720 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  43 
 
 		 723 aa  595  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  41.48 
 
 		 722 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  40.38 
 
 		 724 aa  594  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  41.17 
 
 		 724 aa  594  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  41.48 
 
 		 722 aa  594  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  41.48 
 
 		 722 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  41.55 
 
 		 717 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  41.24 
 
 		 726 aa  589  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  41.44 
 
 		 727 aa  589  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>