More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1696 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  61.41 
 
 
787 aa  949    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  60.62 
 
 
829 aa  942    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  62.17 
 
 
787 aa  965    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5331  UvrD/REP helicase  75.91 
 
 
822 aa  1246    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  60.69 
 
 
744 aa  880    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  62.3 
 
 
787 aa  964    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  45.61 
 
 
721 aa  645    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  45.61 
 
 
721 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  57.25 
 
 
713 aa  840    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  62.93 
 
 
783 aa  967    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  61.41 
 
 
786 aa  956    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  53.8 
 
 
726 aa  765    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  61.06 
 
 
786 aa  942    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  62.42 
 
 
787 aa  964    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  62.3 
 
 
787 aa  965    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  62.3 
 
 
787 aa  964    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  44.15 
 
 
723 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  47.44 
 
 
725 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  53.37 
 
 
743 aa  816    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  62.55 
 
 
787 aa  966    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  69.28 
 
 
788 aa  1081    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  71.68 
 
 
781 aa  1137    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  62.3 
 
 
787 aa  964    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  78.44 
 
 
816 aa  1280    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  61.19 
 
 
786 aa  944    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  71.12 
 
 
814 aa  1144    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  55.33 
 
 
731 aa  825    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  72.03 
 
 
825 aa  1173    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  62.93 
 
 
783 aa  965    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  73.47 
 
 
809 aa  1169    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  48.23 
 
 
739 aa  658    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  62.06 
 
 
786 aa  967    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  62.23 
 
 
787 aa  980    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  78.93 
 
 
818 aa  1305    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  66.14 
 
 
848 aa  1045    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  62.42 
 
 
846 aa  969    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  62.42 
 
 
787 aa  965    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  100 
 
 
793 aa  1630    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  46.58 
 
 
730 aa  637    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.6 
 
 
725 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  62.04 
 
 
840 aa  962    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  62.17 
 
 
787 aa  967    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  60.42 
 
 
788 aa  938    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  61.81 
 
 
790 aa  968    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  62.42 
 
 
787 aa  969    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  62.42 
 
 
787 aa  964    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  78.56 
 
 
826 aa  1280    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  62.3 
 
 
787 aa  964    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  44.92 
 
 
728 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  45.43 
 
 
728 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  45.43 
 
 
728 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  44.92 
 
 
727 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  45.05 
 
 
729 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  47.65 
 
 
735 aa  626  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  45.18 
 
 
741 aa  626  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  44.57 
 
 
728 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  45.66 
 
 
727 aa  622  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  43.85 
 
 
724 aa  622  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  47.28 
 
 
721 aa  624  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  44.37 
 
 
727 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  43.37 
 
 
724 aa  624  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  44.13 
 
 
724 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  44.57 
 
 
728 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  44.12 
 
 
726 aa  623  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  46.25 
 
 
726 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  44.39 
 
 
727 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  44.26 
 
 
722 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  44.01 
 
 
722 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  43.96 
 
 
734 aa  620  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  43.91 
 
 
720 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  44.09 
 
 
720 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  44.42 
 
 
728 aa  617  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  44.09 
 
 
720 aa  616  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  44.26 
 
 
722 aa  617  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  44.81 
 
 
728 aa  615  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  44.98 
 
 
720 aa  616  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  44.42 
 
 
720 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  43.91 
 
 
720 aa  616  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  43.96 
 
 
720 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  43.91 
 
 
720 aa  616  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  43.91 
 
 
720 aa  616  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  44.09 
 
 
720 aa  615  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  43.91 
 
 
720 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  44.42 
 
 
720 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  44.29 
 
 
720 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  43.88 
 
 
722 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  43.75 
 
 
727 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  44.42 
 
 
720 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  44.42 
 
 
720 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  43.96 
 
 
720 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  44.05 
 
 
737 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  44.16 
 
 
720 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  42.47 
 
 
723 aa  614  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  43.88 
 
 
722 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  43.91 
 
 
720 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  44.97 
 
 
721 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  43.75 
 
 
722 aa  612  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  44.09 
 
 
717 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  43.37 
 
 
722 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  43.75 
 
 
722 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>