More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00200 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  66.48 
 
 		 720 aa  1003    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  66.48 
 
 		 720 aa  1003    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  59.02 
 
 		 737 aa  900    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  65.33 
 
 		 720 aa  966    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  60.81 
 
 		 728 aa  902    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  45.39 
 
 		 787 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  44.07 
 
 		 788 aa  646    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  58.21 
 
 		 726 aa  863    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  65.76 
 
 		 734 aa  991    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  43.59 
 
 		 829 aa  651    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  52.49 
 
 		 723 aa  764    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  64.73 
 
 		 724 aa  987    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  55.82 
 
 		 720 aa  823    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  66.34 
 
 		 720 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  66.2 
 
 		 722 aa  994    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  60.03 
 
 		 727 aa  904    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  65.33 
 
 		 720 aa  967    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  66.48 
 
 		 720 aa  1003    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  66.34 
 
 		 720 aa  1001    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  45.39 
 
 		 787 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  56.45 
 
 		 721 aa  847    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  56.45 
 
 		 721 aa  847    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  59.77 
 
 		 727 aa  889    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  49.72 
 
 		 713 aa  697    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  45.19 
 
 		 786 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.23 
 
 		 786 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  48.64 
 
 		 726 aa  681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  56.38 
 
 		 730 aa  819    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  45.49 
 
 		 783 aa  678    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  45.39 
 
 		 787 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  57.89 
 
 		 717 aa  819    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  61.24 
 
 		 727 aa  905    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  64.32 
 
 		 721 aa  973    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  64.82 
 
 		 721 aa  976    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.13 
 
 		 787 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  49.03 
 
 		 709 aa  697    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  44.92 
 
 		 788 aa  664    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  44.95 
 
 		 786 aa  667    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  53.74 
 
 		 741 aa  825    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  66.48 
 
 		 720 aa  1003    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  49.93 
 
 		 743 aa  701    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  59.67 
 
 		 727 aa  876    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  66.34 
 
 		 720 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  45.01 
 
 		 787 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  45.39 
 
 		 787 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  66.34 
 
 		 720 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  65.98 
 
 		 723 aa  988    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  65.46 
 
 		 720 aa  967    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  100 
 
 		 723 aa  1506    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  66.48 
 
 		 720 aa  1003    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  42.12 
 
 		 814 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  58.82 
 
 		 724 aa  879    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  49.52 
 
 		 731 aa  701    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.49 
 
 		 783 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  62.97 
 
 		 722 aa  962    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  55.37 
 
 		 728 aa  807    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  56.58 
 
 		 739 aa  827    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  61.94 
 
 		 728 aa  910    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  44.6 
 
 		 787 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0127  DNA helicase II  55.43 
 
 		 646 aa  724    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.889231  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  60.73 
 
 		 728 aa  896    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  44.25 
 
 		 787 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  45.26 
 
 		 846 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  65.51 
 
 		 722 aa  984    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  65.51 
 
 		 722 aa  985    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  75.69 
 
 		 724 aa  1173    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  44.67 
 
 		 790 aa  673    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  65.65 
 
 		 722 aa  987    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  66.34 
 
 		 720 aa  1001    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  66.48 
 
 		 720 aa  1003    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  57.16 
 
 		 726 aa  872    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  54.05 
 
 		 725 aa  775    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  65.79 
 
 		 722 aa  990    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  65.79 
 
 		 722 aa  990    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  56.03 
 
 		 725 aa  824    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  64.7 
 
 		 727 aa  991    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  45.39 
 
 		 787 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  66.34 
 
 		 720 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  45.39 
 
 		 840 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  61.8 
 
 		 728 aa  910    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  65.46 
 
 		 723 aa  994    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  64.13 
 
 		 721 aa  981    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  52.77 
 
 		 723 aa  770    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  45.26 
 
 		 787 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  66.67 
 
 		 724 aa  1013    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  45.26 
 
 		 787 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  45.26 
 
 		 787 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  61.01 
 
 		 728 aa  902    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  65.79 
 
 		 722 aa  991    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  60.03 
 
 		 729 aa  895    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  45.39 
 
 		 787 aa  677    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  65.51 
 
 		 722 aa  984    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  55.68 
 
 		 723 aa  820    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  66.34 
 
 		 720 aa  998    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  65.79 
 
 		 721 aa  983    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  64.69 
 
 		 726 aa  997    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0008  UvrD/REP helicase  57.34 
 
 		 723 aa  845    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  45.39 
 
 		 787 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  59.67 
 
 		 726 aa  898    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  66.48 
 
 		 720 aa  1003    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>