More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1322 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  44.57 
 
 		 720 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  44.57 
 
 		 720 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5331  UvrD/REP helicase  62.05 
 
 		 822 aa  959    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  46.43 
 
 		 728 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  46.43 
 
 		 728 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  46.18 
 
 		 722 aa  673    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  63.31 
 
 		 788 aa  1013    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  47.17 
 
 		 726 aa  665    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  69.25 
 
 		 829 aa  1131    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  44.7 
 
 		 720 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  45.35 
 
 		 724 aa  661    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  44.84 
 
 		 728 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  47.6 
 
 		 721 aa  667    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  45.97 
 
 		 722 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  45.8 
 
 		 727 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  44.57 
 
 		 720 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  86.82 
 
 		 783 aa  1424    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  44.57 
 
 		 720 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  91.49 
 
 		 787 aa  1490    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  62.79 
 
 		 809 aa  989    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  45.99 
 
 		 727 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  59.34 
 
 		 713 aa  902    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  43.94 
 
 		 734 aa  648    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  91.49 
 
 		 787 aa  1491    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  70.52 
 
 		 786 aa  1143    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  58.44 
 
 		 726 aa  877    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  44.57 
 
 		 720 aa  648    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  45.08 
 
 		 721 aa  664    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  91.49 
 
 		 787 aa  1491    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  62.77 
 
 		 826 aa  974    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  45.22 
 
 		 727 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  44.57 
 
 		 720 aa  647    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  44.7 
 
 		 720 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  95.55 
 
 		 787 aa  1565    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  95.81 
 
 		 786 aa  1558    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  63.61 
 
 		 788 aa  996    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  62.64 
 
 		 816 aa  971    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  44.65 
 
 		 726 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  45.73 
 
 		 729 aa  656    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  47.1 
 
 		 741 aa  682    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  45.53 
 
 		 728 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  91.49 
 
 		 787 aa  1490    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  45.93 
 
 		 722 aa  672    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  56.91 
 
 		 743 aa  889    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  44.7 
 
 		 724 aa  663    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  92.25 
 
 		 787 aa  1502    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  91.49 
 
 		 787 aa  1490    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  44.99 
 
 		 720 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  99.87 
 
 		 787 aa  1623    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  61.43 
 
 		 814 aa  969    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  44.61 
 
 		 724 aa  651    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  58.11 
 
 		 731 aa  887    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.73 
 
 		 825 aa  979    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  86.66 
 
 		 783 aa  1424    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  44.82 
 
 		 722 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.58 
 
 		 739 aa  660    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  71.52 
 
 		 787 aa  1154    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  45.39 
 
 		 723 aa  674    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  45.56 
 
 		 722 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  44.7 
 
 		 720 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  45.98 
 
 		 730 aa  653    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  91.49 
 
 		 787 aa  1490    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  94.11 
 
 		 846 aa  1615    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  45.78 
 
 		 727 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  44.7 
 
 		 720 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  44.44 
 
 		 724 aa  662    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  61.01 
 
 		 848 aa  967    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  46.11 
 
 		 722 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  45.93 
 
 		 722 aa  672    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  44.78 
 
 		 721 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  46.46 
 
 		 726 aa  655    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  61.79 
 
 		 793 aa  955    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  45.84 
 
 		 722 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  45.97 
 
 		 722 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.68 
 
 		 725 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  45.15 
 
 		 727 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  88.73 
 
 		 790 aa  1463    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  44.57 
 
 		 720 aa  647    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 840 aa  1734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  45.79 
 
 		 728 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  44.93 
 
 		 721 aa  663    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  45.92 
 
 		 728 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  45.79 
 
 		 720 aa  655    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  44.7 
 
 		 720 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  43.83 
 
 		 737 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  44.15 
 
 		 723 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  95.93 
 
 		 787 aa  1571    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  95.68 
 
 		 787 aa  1567    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  46.1 
 
 		 722 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  70.04 
 
 		 786 aa  1137    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  60.58 
 
 		 781 aa  936    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  45.91 
 
 		 723 aa  660    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  44.57 
 
 		 720 aa  648    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  45.01 
 
 		 723 aa  667    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  46.04 
 
 		 721 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  91.49 
 
 		 787 aa  1491    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  61.01 
 
 		 744 aa  935    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  64.42 
 
 		 787 aa  1037    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  44.77 
 
 		 726 aa  659    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  63.38 
 
 		 818 aa  996    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>