More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1120 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  53.79 
 
 
720 aa  797    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  53.79 
 
 
720 aa  797    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  51.29 
 
 
737 aa  738    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  51.98 
 
 
723 aa  743    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  54.42 
 
 
728 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  51.72 
 
 
709 aa  706    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  52.2 
 
 
721 aa  778    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  55.75 
 
 
726 aa  805    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.19 
 
 
816 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  52.34 
 
 
720 aa  772    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  53.02 
 
 
720 aa  761    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  51.03 
 
 
724 aa  759    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  51.92 
 
 
723 aa  762    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  54.03 
 
 
728 aa  773    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  52.13 
 
 
722 aa  772    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  53.94 
 
 
727 aa  766    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  51.77 
 
 
730 aa  740    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  53.02 
 
 
720 aa  761    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  54.02 
 
 
720 aa  764    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  45.88 
 
 
786 aa  638    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  53.11 
 
 
721 aa  769    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  53.11 
 
 
721 aa  770    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  54.21 
 
 
727 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  48.97 
 
 
713 aa  684    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  51.85 
 
 
722 aa  769    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  48.62 
 
 
744 aa  660    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.95 
 
 
788 aa  665    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  47.98 
 
 
726 aa  657    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  44.92 
 
 
783 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  53.66 
 
 
720 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  54.56 
 
 
717 aa  775    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  55.11 
 
 
727 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  44.38 
 
 
786 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  53.38 
 
 
720 aa  792    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  55.28 
 
 
726 aa  761    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  53.79 
 
 
720 aa  797    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  53.66 
 
 
720 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.09 
 
 
818 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  51.87 
 
 
741 aa  742    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  54.28 
 
 
728 aa  771    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  46.83 
 
 
743 aa  658    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  45.59 
 
 
787 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  45.29 
 
 
788 aa  643    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  53.43 
 
 
720 aa  783    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  53.79 
 
 
720 aa  797    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  54.17 
 
 
725 aa  741    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  52.47 
 
 
720 aa  773    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  45.23 
 
 
809 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  54.48 
 
 
729 aa  774    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  51.72 
 
 
709 aa  706    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  52.62 
 
 
721 aa  776    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  53.79 
 
 
720 aa  797    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  53.31 
 
 
724 aa  754    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  49.46 
 
 
731 aa  708    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  51.85 
 
 
722 aa  770    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.17 
 
 
783 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  52.27 
 
 
722 aa  788    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  53.66 
 
 
720 aa  797    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  53.17 
 
 
739 aa  758    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  53.66 
 
 
720 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  45.5 
 
 
787 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  50.47 
 
 
734 aa  750    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  53.02 
 
 
720 aa  761    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  45.88 
 
 
786 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  53.66 
 
 
720 aa  797    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  58.31 
 
 
721 aa  819    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  53.66 
 
 
720 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  52.32 
 
 
728 aa  736    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  52.13 
 
 
724 aa  772    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  52.26 
 
 
726 aa  780    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  53.02 
 
 
723 aa  776    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  51.72 
 
 
724 aa  761    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  53.66 
 
 
720 aa  797    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  50.62 
 
 
726 aa  738    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  51.86 
 
 
722 aa  769    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  51.71 
 
 
722 aa  770    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  54.62 
 
 
725 aa  783    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  52.46 
 
 
727 aa  780    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  54.31 
 
 
726 aa  783    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  53.66 
 
 
720 aa  796    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  53.57 
 
 
720 aa  778    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  54.03 
 
 
728 aa  774    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  51.86 
 
 
722 aa  768    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  52.34 
 
 
721 aa  775    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  54.56 
 
 
728 aa  777    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  53.66 
 
 
720 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  51.85 
 
 
722 aa  769    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  52 
 
 
724 aa  761    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  100 
 
 
728 aa  1493    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  53.88 
 
 
723 aa  764    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  51.71 
 
 
722 aa  770    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  51.98 
 
 
723 aa  743    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  44.35 
 
 
790 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  45.19 
 
 
826 aa  639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  54.05 
 
 
727 aa  760    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  53.17 
 
 
735 aa  747    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  52.97 
 
 
721 aa  767    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  51.85 
 
 
722 aa  770    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0008  UvrD/REP helicase  51.71 
 
 
723 aa  716    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680024  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  50.89 
 
 
723 aa  739    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>