More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2854 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 643 aa  1244    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.77 
 
 		 689 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  46.89 
 
 		 736 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  45.72 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  47.15 
 
 		 697 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  42.93 
 
 		 717 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  43.85 
 
 		 726 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  43.75 
 
 		 702 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  43.86 
 
 		 712 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.08 
 
 		 709 aa  388  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  43.48 
 
 		 708 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  46.99 
 
 		 674 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  45.77 
 
 		 701 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  46.84 
 
 		 685 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.16 
 
 		 699 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  44.41 
 
 		 688 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.6 
 
 		 694 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  43.55 
 
 		 697 aa  379  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  43.6 
 
 		 787 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  43.43 
 
 		 700 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  45.6 
 
 		 684 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  46.32 
 
 		 759 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  47.89 
 
 		 670 aa  363  4e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  43.38 
 
 		 717 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  46.27 
 
 		 685 aa  362  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  44.56 
 
 		 719 aa  360  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.04 
 
 		 704 aa  354  2.9999999999999997e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  44.33 
 
 		 714 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  45.02 
 
 		 707 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  44.33 
 
 		 707 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  43.42 
 
 		 719 aa  352  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  41.07 
 
 		 690 aa  342  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.5 
 
 		 710 aa  335  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  42.08 
 
 		 707 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  40.26 
 
 		 710 aa  327  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  47.43 
 
 		 876 aa  284  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  43.68 
 
 		 508 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  32.48 
 
 		 646 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  24.29 
 
 		 687 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.8 
 
 		 806 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.39 
 
 		 757 aa  212  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  35.2 
 
 		 730 aa  211  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.56 
 
 		 765 aa  210  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  26.82 
 
 		 727 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.27 
 
 		 751 aa  207  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  35.17 
 
 		 715 aa  203  7e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.1 
 
 		 729 aa  203  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  36.98 
 
 		 678 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  34.29 
 
 		 728 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  27.6 
 
 		 671 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  36.54 
 
 		 682 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  36.41 
 
 		 515 aa  197  6e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.26 
 
 		 787 aa  197  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.19 
 
 		 719 aa  197  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.31 
 
 		 731 aa  196  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.99 
 
 		 713 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  31.85 
 
 		 681 aa  195  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.17 
 
 		 726 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  28.39 
 
 		 671 aa  194  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.17 
 
 		 838 aa  194  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.03 
 
 		 786 aa  193  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.65 
 
 		 754 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.18 
 
 		 797 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.88 
 
 		 671 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.89 
 
 		 730 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  29.12 
 
 		 724 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.73 
 
 		 742 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.7 
 
 		 751 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.86 
 
 		 715 aa  191  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.9 
 
 		 787 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  24.65 
 
 		 706 aa  190  8e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  30.88 
 
 		 723 aa  189  9e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  30.88 
 
 		 723 aa  189  9e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  34.97 
 
 		 797 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.27 
 
 		 768 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 		 846 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  35.01 
 
 		 759 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 840 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 		 787 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 		 787 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  31.94 
 
 		 787 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  31.48 
 
 		 790 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.68 
 
 		 730 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.68 
 
 		 730 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  34.97 
 
 		 797 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.42 
 
 		 858 aa  187  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  34.53 
 
 		 751 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  32.43 
 
 		 787 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  32.43 
 
 		 787 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  32.43 
 
 		 787 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.59 
 
 		 772 aa  187  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  32.43 
 
 		 787 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  33.68 
 
 		 671 aa  187  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 		 783 aa  187  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  32.2 
 
 		 787 aa  186  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  30.79 
 
 		 625 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  32.2 
 
 		 787 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.71 
 
 		 783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  32.2 
 
 		 787 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  31.72 
 
 		 1032 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>