More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0715 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  52.23 
 
 		 701 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  58.63 
 
 		 670 aa  678    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  58.05 
 
 		 685 aa  671    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 690 aa  1389    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  58.43 
 
 		 699 aa  726    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  55.37 
 
 		 684 aa  663    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  51.07 
 
 		 726 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  51.29 
 
 		 717 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  51.42 
 
 		 709 aa  627  1e-178  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  50.58 
 
 		 702 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  51.89 
 
 		 674 aa  608  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  48.07 
 
 		 710 aa  597  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.12 
 
 		 689 aa  598  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  49.34 
 
 		 704 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  47.53 
 
 		 787 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  47.9 
 
 		 682 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  46.71 
 
 		 712 aa  581  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  46.22 
 
 		 708 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  47.76 
 
 		 688 aa  557  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  46.51 
 
 		 736 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  47.56 
 
 		 719 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  45.67 
 
 		 697 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  46.53 
 
 		 719 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  45.54 
 
 		 710 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.49 
 
 		 694 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  45.2 
 
 		 707 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  42.65 
 
 		 697 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  44.69 
 
 		 714 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  45.55 
 
 		 685 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  45.17 
 
 		 707 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  45.03 
 
 		 707 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  43.88 
 
 		 717 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  44.91 
 
 		 759 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  43.51 
 
 		 700 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  55.28 
 
 		 876 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  41.53 
 
 		 643 aa  333  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  36.66 
 
 		 515 aa  330  8e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  48.28 
 
 		 508 aa  312  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  32.44 
 
 		 768 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  32.19 
 
 		 739 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  28.46 
 
 		 689 aa  250  5e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 		 714 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.86 
 
 		 715 aa  243  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  28.21 
 
 		 724 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  28.82 
 
 		 625 aa  236  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.1 
 
 		 689 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  31.6 
 
 		 790 aa  228  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.14 
 
 		 838 aa  226  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  31.72 
 
 		 800 aa  223  9e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  31.48 
 
 		 741 aa  223  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.69 
 
 		 783 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  30.69 
 
 		 786 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  29.64 
 
 		 707 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 743 aa  220  8.999999999999998e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  28.23 
 
 		 735 aa  217  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.6 
 
 		 686 aa  217  5e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  30.19 
 
 		 817 aa  216  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  30.41 
 
 		 706 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.31 
 
 		 763 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  28.75 
 
 		 620 aa  215  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  29.8 
 
 		 783 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  31.36 
 
 		 795 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  27.01 
 
 		 706 aa  213  7.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  27.5 
 
 		 749 aa  213  9e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2436  UvrD/REP helicase  31.01 
 
 		 778 aa  213  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0016628  normal  0.650689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.91 
 
 		 795 aa  212  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  33.22 
 
 		 1032 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  33.71 
 
 		 1089 aa  212  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  31.2 
 
 		 795 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.19 
 
 		 757 aa  211  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  31.14 
 
 		 804 aa  211  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  28.23 
 
 		 816 aa  211  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  29.64 
 
 		 816 aa  211  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.34 
 
 		 794 aa  211  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.93 
 
 		 876 aa  210  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.72 
 
 		 892 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  32.86 
 
 		 1050 aa  209  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  29.62 
 
 		 825 aa  209  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  31.04 
 
 		 798 aa  209  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  29.62 
 
 		 728 aa  208  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.74 
 
 		 773 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  28.67 
 
 		 762 aa  204  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.12 
 
 		 806 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  28.43 
 
 		 734 aa  204  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  29.14 
 
 		 826 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  28.51 
 
 		 833 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  34.22 
 
 		 779 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.2 
 
 		 754 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  29.83 
 
 		 858 aa  201  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.58 
 
 		 932 aa  201  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.83 
 
 		 768 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.89 
 
 		 729 aa  200  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  27.36 
 
 		 634 aa  200  7.999999999999999e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1413  DNA helicase II  28.1 
 
 		 858 aa  200  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338777  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.4 
 
 		 768 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6141  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.6 
 
 		 855 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2023  UvrD/REP helicase  28.42 
 
 		 845 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3367  UvrD/REP helicase  27.99 
 
 		 847 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  31.1 
 
 		 816 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  30.88 
 
 		 789 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.305736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>