More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2469 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  67.12 
 
 		 699 aa  845    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  55.35 
 
 		 709 aa  692    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  54.06 
 
 		 710 aa  666    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  56.41 
 
 		 682 aa  669    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  55.19 
 
 		 702 aa  656    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  60.2 
 
 		 701 aa  752    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  58.54 
 
 		 717 aa  739    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  64.97 
 
 		 684 aa  769    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 670 aa  1296    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  54.6 
 
 		 689 aa  656    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  69.25 
 
 		 685 aa  826    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  57.49 
 
 		 726 aa  726    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  58.63 
 
 		 690 aa  719    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  52.03 
 
 		 712 aa  630  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.53 
 
 		 704 aa  629  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  51.66 
 
 		 708 aa  624  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  55.78 
 
 		 674 aa  621  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  52.47 
 
 		 736 aa  611  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  49.53 
 
 		 787 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  52.92 
 
 		 688 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  54 
 
 		 694 aa  594  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  50.14 
 
 		 697 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  50.42 
 
 		 710 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  51.08 
 
 		 707 aa  558  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  52.38 
 
 		 719 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  51.9 
 
 		 719 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  52.55 
 
 		 685 aa  555  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  50.57 
 
 		 714 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  50.57 
 
 		 707 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  50.57 
 
 		 707 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  48.85 
 
 		 700 aa  548  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  50.07 
 
 		 759 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  48.56 
 
 		 717 aa  535  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  47.29 
 
 		 697 aa  528  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  60.55 
 
 		 876 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  47.89 
 
 		 643 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  37.85 
 
 		 515 aa  323  8e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  46.7 
 
 		 508 aa  292  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  28.66 
 
 		 689 aa  256  8e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  29.01 
 
 		 724 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.03 
 
 		 689 aa  253  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  30.65 
 
 		 762 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.76 
 
 		 751 aa  246  9e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.77 
 
 		 686 aa  244  3.9999999999999997e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.76 
 
 		 751 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  26.75 
 
 		 687 aa  243  7e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.71 
 
 		 786 aa  239  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  28.46 
 
 		 681 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.59 
 
 		 737 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  38.92 
 
 		 715 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.76 
 
 		 729 aa  233  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  29.82 
 
 		 738 aa  233  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 738 aa  233  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  31.83 
 
 		 790 aa  232  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  33.18 
 
 		 739 aa  231  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  28.71 
 
 		 625 aa  231  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.75 
 
 		 741 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  30.86 
 
 		 707 aa  228  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  26.59 
 
 		 757 aa  227  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  32.21 
 
 		 721 aa  226  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  31.07 
 
 		 807 aa  225  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  30.02 
 
 		 758 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  32.27 
 
 		 714 aa  223  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  30.85 
 
 		 705 aa  223  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  31.26 
 
 		 728 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  35.17 
 
 		 1050 aa  221  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 735 aa  221  3e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.85 
 
 		 685 aa  221  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.75 
 
 		 725 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  29.74 
 
 		 620 aa  220  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  31.38 
 
 		 760 aa  219  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.65 
 
 		 757 aa  218  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.54 
 
 		 768 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  28.04 
 
 		 696 aa  219  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 741 aa  218  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.29 
 
 		 876 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  30.83 
 
 		 762 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  29.21 
 
 		 826 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.8 
 
 		 763 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.96 
 
 		 730 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0110  superfamily I DNA and RNA helicase  38.65 
 
 		 401 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.285644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  29.06 
 
 		 825 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  29.06 
 
 		 634 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  27.8 
 
 		 638 aa  213  1e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1369  DNA helicase II  27.88 
 
 		 858 aa  211  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261872  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 723 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3367  UvrD/REP helicase  29.71 
 
 		 847 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561637 
 
 
-
 
NC_004310  BR1413  DNA helicase II  27.88 
 
 		 858 aa  210  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338777  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  30.61 
 
 		 816 aa  211  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  30.26 
 
 		 845 aa  210  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  29.3 
 
 		 833 aa  209  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.97 
 
 		 715 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  34.48 
 
 		 1089 aa  209  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  32.24 
 
 		 706 aa  209  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  28.64 
 
 		 786 aa  208  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  29.55 
 
 		 743 aa  208  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2023  UvrD/REP helicase  29.73 
 
 		 845 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  36.3 
 
 		 746 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.98 
 
 		 711 aa  207  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1764  UvrD/REP helicase  27.66 
 
 		 864 aa  207  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>