More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1427 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  63.36 
 
 		 717 aa  786    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  57.02 
 
 		 682 aa  663    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  54.91 
 
 		 674 aa  643    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  52.45 
 
 		 717 aa  665    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  53.4 
 
 		 712 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  54.15 
 
 		 708 aa  670    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  60.14 
 
 		 694 aa  731    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  59.23 
 
 		 685 aa  696    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  52.63 
 
 		 701 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  51.36 
 
 		 787 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 714 aa  1404    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  54.27 
 
 		 697 aa  638    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  82.03 
 
 		 707 aa  1120    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.76 
 
 		 709 aa  639    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  55.75 
 
 		 689 aa  660    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  78.47 
 
 		 700 aa  1073    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  52.09 
 
 		 726 aa  660    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  55.06 
 
 		 702 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 707 aa  1403    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  81.44 
 
 		 710 aa  1129    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  61.23 
 
 		 697 aa  807    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  99.72 
 
 		 707 aa  1397    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  53.99 
 
 		 736 aa  621  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  55.17 
 
 		 719 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  54.93 
 
 		 719 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  53.4 
 
 		 759 aa  612  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  48.23 
 
 		 710 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  50.57 
 
 		 688 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  49.86 
 
 		 699 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  48.72 
 
 		 684 aa  558  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  50.57 
 
 		 670 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  50.58 
 
 		 685 aa  551  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  69.66 
 
 		 876 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  45.03 
 
 		 690 aa  524  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.72 
 
 		 704 aa  524  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  45.02 
 
 		 643 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  45.55 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.62 
 
 		 732 aa  280  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  30.85 
 
 		 689 aa  279  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  30.99 
 
 		 807 aa  275  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.63 
 
 		 773 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.2 
 
 		 718 aa  270  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  33.13 
 
 		 736 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.82 
 
 		 741 aa  260  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  30.26 
 
 		 714 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  32.26 
 
 		 720 aa  257  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  32.26 
 
 		 720 aa  257  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  32.26 
 
 		 720 aa  257  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  32.26 
 
 		 720 aa  257  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  32.26 
 
 		 720 aa  257  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  32.26 
 
 		 720 aa  257  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  32.12 
 
 		 720 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.75 
 
 		 686 aa  256  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  32.12 
 
 		 720 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  32.12 
 
 		 720 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  32.17 
 
 		 720 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  32.17 
 
 		 720 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  32.17 
 
 		 720 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  32.17 
 
 		 720 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.33 
 
 		 838 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  32.12 
 
 		 720 aa  254  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  33.43 
 
 		 707 aa  248  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  32.02 
 
 		 720 aa  248  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  29.41 
 
 		 625 aa  248  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  34.56 
 
 		 725 aa  246  8e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  31.38 
 
 		 723 aa  245  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.57 
 
 		 851 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  39.61 
 
 		 746 aa  242  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  31.18 
 
 		 720 aa  241  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  31.18 
 
 		 720 aa  241  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.32 
 
 		 758 aa  240  5.999999999999999e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  31.18 
 
 		 720 aa  240  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  30.07 
 
 		 722 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.2 
 
 		 742 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  39.45 
 
 		 515 aa  239  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  29.79 
 
 		 724 aa  239  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  37.29 
 
 		 744 aa  238  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  39.11 
 
 		 715 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  28.99 
 
 		 721 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  29.18 
 
 		 721 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 		 817 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  31.17 
 
 		 720 aa  233  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.3 
 
 		 781 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  31.23 
 
 		 720 aa  232  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  29.78 
 
 		 722 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  31.04 
 
 		 720 aa  232  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  37.23 
 
 		 739 aa  231  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  29.63 
 
 		 722 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  29.63 
 
 		 722 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  31.35 
 
 		 723 aa  230  6e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.19 
 
 		 763 aa  230  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  31.09 
 
 		 720 aa  230  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  35.52 
 
 		 689 aa  229  1e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  30.53 
 
 		 723 aa  229  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.56 
 
 		 725 aa  229  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.5 
 
 		 762 aa  227  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.38 
 
 		 730 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  29.99 
 
 		 724 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.22 
 
 		 785 aa  227  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2436  UvrD/REP helicase  31.65 
 
 		 778 aa  225  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0016628  normal  0.650689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>