More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7799 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.62 
 
 		 699 aa  644    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  51.57 
 
 		 707 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  57.02 
 
 		 689 aa  748    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  50.2 
 
 		 697 aa  644    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  54.1 
 
 		 712 aa  739    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  53.9 
 
 		 685 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  53.85 
 
 		 708 aa  724    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 787 aa  1576    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  56.87 
 
 		 682 aa  744    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  56.1 
 
 		 717 aa  753    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.81 
 
 		 709 aa  706    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  54.77 
 
 		 736 aa  677    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  57.87 
 
 		 702 aa  753    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  52.21 
 
 		 697 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  51.22 
 
 		 714 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  55.17 
 
 		 674 aa  695    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.81 
 
 		 710 aa  637    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  52.93 
 
 		 719 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  54.89 
 
 		 726 aa  758    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  56.89 
 
 		 701 aa  774    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  54.75 
 
 		 688 aa  689    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  51.22 
 
 		 707 aa  636    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  51.36 
 
 		 710 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  52.2 
 
 		 719 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  51.36 
 
 		 707 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  60.65 
 
 		 684 aa  633  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  50 
 
 		 704 aa  629  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  48.91 
 
 		 700 aa  625  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  51.93 
 
 		 759 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.02 
 
 		 694 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  49.27 
 
 		 717 aa  620  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  52.71 
 
 		 685 aa  618  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  49.66 
 
 		 670 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  47.39 
 
 		 690 aa  594  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  60.05 
 
 		 876 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  43.27 
 
 		 643 aa  372  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  46.77 
 
 		 508 aa  313  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  37.12 
 
 		 739 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  35.05 
 
 		 744 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.21 
 
 		 742 aa  294  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.88 
 
 		 838 aa  294  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  31.11 
 
 		 625 aa  289  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.5 
 
 		 785 aa  289  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.45 
 
 		 773 aa  286  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.93 
 
 		 685 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  30.97 
 
 		 714 aa  284  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.93 
 
 		 858 aa  283  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.77 
 
 		 858 aa  282  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.39 
 
 		 795 aa  281  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  33.14 
 
 		 762 aa  280  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.51 
 
 		 763 aa  279  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  33.91 
 
 		 736 aa  280  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  30.81 
 
 		 689 aa  278  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.98 
 
 		 806 aa  277  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  30.14 
 
 		 735 aa  275  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  33.62 
 
 		 762 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  41.82 
 
 		 515 aa  274  5.000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  29.95 
 
 		 757 aa  274  5.000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.05 
 
 		 729 aa  273  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  29.32 
 
 		 687 aa  273  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.79 
 
 		 851 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  36.69 
 
 		 715 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  34.38 
 
 		 707 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.64 
 
 		 794 aa  271  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.54 
 
 		 802 aa  271  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  31.88 
 
 		 678 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.39 
 
 		 831 aa  270  5.9999999999999995e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.75 
 
 		 759 aa  269  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  34.06 
 
 		 732 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.91 
 
 		 730 aa  270  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.91 
 
 		 730 aa  270  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  31.7 
 
 		 681 aa  270  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  34.22 
 
 		 731 aa  269  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.52 
 
 		 689 aa  269  1e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.13 
 
 		 772 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  34.73 
 
 		 795 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.56 
 
 		 671 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.35 
 
 		 694 aa  269  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.75 
 
 		 857 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  30.84 
 
 		 807 aa  268  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  33.74 
 
 		 817 aa  267  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.78 
 
 		 833 aa  267  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.41 
 
 		 753 aa  266  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.63 
 
 		 741 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.78 
 
 		 747 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  31.81 
 
 		 741 aa  265  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.7 
 
 		 718 aa  265  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  31.32 
 
 		 770 aa  266  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  35.3 
 
 		 798 aa  265  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  35.03 
 
 		 795 aa  265  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.98 
 
 		 751 aa  264  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.64 
 
 		 765 aa  263  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.73 
 
 		 747 aa  262  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  33.53 
 
 		 800 aa  262  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.82 
 
 		 751 aa  262  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.58 
 
 		 753 aa  261  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  30.73 
 
 		 751 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2483  DNA helicase II  32.87 
 
 		 807 aa  261  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.73 
 
 		 751 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  31.5 
 
 		 682 aa  261  4e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>