More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0437 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  58.47 
 
 
689 aa  823    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  51.96 
 
 
687 aa  697    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  56.01 
 
 
686 aa  746    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  59.19 
 
 
689 aa  828    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  63.96 
 
 
681 aa  894    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  100 
 
 
682 aa  1388    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  57.6 
 
 
685 aa  783    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1119  ATP-dependent DNA helicase UvrD  50 
 
 
691 aa  598  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1244  ATP-dependent DNA helicase UvrD  50 
 
 
691 aa  598  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0621  ATP-dependent DNA helicase UvrD  50 
 
 
691 aa  596  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258916  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.76 
 
 
729 aa  455  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  37.48 
 
 
757 aa  449  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.51 
 
 
732 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.92 
 
 
729 aa  448  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.21 
 
 
730 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.21 
 
 
730 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.83 
 
 
694 aa  445  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.55 
 
 
741 aa  445  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.95 
 
 
715 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.85 
 
 
725 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  37.87 
 
 
707 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.77 
 
 
785 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  39.65 
 
 
739 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  37.75 
 
 
724 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.76 
 
 
742 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  37.55 
 
 
735 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.76 
 
 
737 aa  429  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.24 
 
 
759 aa  424  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  37.23 
 
 
768 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  37.86 
 
 
743 aa  423  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.51 
 
 
758 aa  423  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.75 
 
 
772 aa  422  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  37.46 
 
 
714 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.66 
 
 
753 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.74 
 
 
756 aa  422  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  36.01 
 
 
705 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  38.92 
 
 
744 aa  422  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.1 
 
 
751 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.38 
 
 
747 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.1 
 
 
751 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  39.1 
 
 
753 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  39.1 
 
 
751 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.1 
 
 
747 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  38.95 
 
 
731 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.5 
 
 
753 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.1 
 
 
751 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  38.79 
 
 
732 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.13 
 
 
741 aa  415  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.38 
 
 
762 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.49 
 
 
755 aa  415  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  35.4 
 
 
709 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  39.34 
 
 
731 aa  413  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  35.4 
 
 
709 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.28 
 
 
747 aa  416  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  37.82 
 
 
762 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.89 
 
 
734 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.52 
 
 
718 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  36.26 
 
 
735 aa  412  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.72 
 
 
757 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.69 
 
 
711 aa  411  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  36.62 
 
 
680 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  37.04 
 
 
736 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  37.62 
 
 
892 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  36.58 
 
 
706 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  38.72 
 
 
770 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  36.54 
 
 
728 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  36.14 
 
 
741 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  36.6 
 
 
743 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.22 
 
 
765 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  36.48 
 
 
812 aa  404  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  36.66 
 
 
749 aa  403  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  36.48 
 
 
739 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  37.65 
 
 
795 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  37.13 
 
 
773 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.18 
 
 
754 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  37.65 
 
 
795 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  36.48 
 
 
778 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.83 
 
 
763 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  34.6 
 
 
721 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  34.6 
 
 
721 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  36.78 
 
 
665 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  34.24 
 
 
741 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.03 
 
 
671 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.08 
 
 
838 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.94 
 
 
730 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  37.84 
 
 
798 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.98 
 
 
1023 aa  399  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  36.73 
 
 
672 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  34.85 
 
 
726 aa  398  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  35.84 
 
 
735 aa  395  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.42 
 
 
802 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.64 
 
 
797 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  37.31 
 
 
797 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  36.79 
 
 
797 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.94 
 
 
751 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.94 
 
 
751 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  36.79 
 
 
797 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  37.72 
 
 
804 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  38.41 
 
 
630 aa  391  1e-107  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  36.91 
 
 
682 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>