More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3807 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  53.31 
 
 		 709 aa  699    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  52.59 
 
 		 717 aa  643    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.82 
 
 		 699 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  53.84 
 
 		 697 aa  657    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  55.6 
 
 		 717 aa  746    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  55.49 
 
 		 719 aa  673    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  71.64 
 
 		 712 aa  969    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  56.81 
 
 		 694 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  52.96 
 
 		 736 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  63.28 
 
 		 682 aa  827    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  54.92 
 
 		 685 aa  646    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  54.15 
 
 		 714 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  63.92 
 
 		 689 aa  842    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  54.02 
 
 		 707 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  56.24 
 
 		 701 aa  737    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  52.29 
 
 		 697 aa  676    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  51.85 
 
 		 700 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  54.79 
 
 		 674 aa  644    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  55.68 
 
 		 726 aa  743    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  53.85 
 
 		 787 aa  713    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  53.33 
 
 		 688 aa  661    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 708 aa  1424    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  54.15 
 
 		 707 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  55.86 
 
 		 719 aa  666    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  55.08 
 
 		 710 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  62.66 
 
 		 702 aa  823    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  54.15 
 
 		 707 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  54.76 
 
 		 685 aa  632  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  53.4 
 
 		 684 aa  632  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  51.03 
 
 		 759 aa  628  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  49.58 
 
 		 704 aa  621  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  48.78 
 
 		 710 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  51.52 
 
 		 670 aa  589  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  46.22 
 
 		 690 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  60.64 
 
 		 876 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  43.48 
 
 		 643 aa  379  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  46.24 
 
 		 508 aa  297  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  33.59 
 
 		 739 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  38.76 
 
 		 515 aa  264  4.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  29.35 
 
 		 689 aa  261  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  29.11 
 
 		 625 aa  260  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  27.53 
 
 		 689 aa  253  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  29.05 
 
 		 687 aa  251  4e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.19 
 
 		 686 aa  243  6e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.54 
 
 		 743 aa  243  9e-63  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.63 
 
 		 759 aa  240  5e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  31.24 
 
 		 790 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 		 735 aa  238  4e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.75 
 
 		 851 aa  237  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  29.89 
 
 		 735 aa  236  7e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  30.53 
 
 		 800 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  27.19 
 
 		 787 aa  234  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  31.35 
 
 		 817 aa  233  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.13 
 
 		 715 aa  233  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  30.98 
 
 		 726 aa  233  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  30.48 
 
 		 825 aa  230  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  30.61 
 
 		 620 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  28.64 
 
 		 816 aa  229  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  30.48 
 
 		 826 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  34.21 
 
 		 1050 aa  228  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  30.63 
 
 		 744 aa  228  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.37 
 
 		 786 aa  225  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.4 
 
 		 718 aa  224  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.39 
 
 		 730 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.67 
 
 		 732 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.17 
 
 		 892 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  30.89 
 
 		 726 aa  223  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  28.73 
 
 		 741 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  29.89 
 
 		 816 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  29.41 
 
 		 743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  32.84 
 
 		 714 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1369  DNA helicase II  29.75 
 
 		 858 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1413  DNA helicase II  29.75 
 
 		 858 aa  220  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.64 
 
 		 742 aa  220  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  28.93 
 
 		 630 aa  220  6e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  31.61 
 
 		 728 aa  219  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  30.2 
 
 		 668 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  31.54 
 
 		 760 aa  219  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3367  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 847 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561637 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  29.6 
 
 		 799 aa  218  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.46 
 
 		 673 aa  218  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.83 
 
 		 729 aa  216  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2023  UvrD/REP helicase  28.16 
 
 		 845 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  29.8 
 
 		 678 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2739  UvrD/REP helicase  29.38 
 
 		 833 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.3 
 
 		 876 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.19 
 
 		 690 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.41 
 
 		 763 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.43 
 
 		 713 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  30.49 
 
 		 659 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  29.31 
 
 		 858 aa  214  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29 
 
 		 725 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.03 
 
 		 768 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  28.35 
 
 		 724 aa  214  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1764  UvrD/REP helicase  29.05 
 
 		 864 aa  214  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  29.97 
 
 		 768 aa  213  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  33.39 
 
 		 1089 aa  213  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.11 
 
 		 737 aa  213  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  27 
 
 		 655 aa  213  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.23 
 
 		 658 aa  212  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>