More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0502 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 620 aa  1280    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  49.52 
 
 		 616 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.42 
 
 		 729 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.43 
 
 		 772 aa  388  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 706 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.21 
 
 		 759 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.19 
 
 		 751 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.19 
 
 		 751 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.91 
 
 		 718 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.11 
 
 		 755 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.72 
 
 		 729 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  37.93 
 
 		 737 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.3 
 
 		 715 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.56 
 
 		 730 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.56 
 
 		 730 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  39.39 
 
 		 714 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.72 
 
 		 737 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  37.38 
 
 		 765 aa  378  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  36.9 
 
 		 735 aa  374  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.24 
 
 		 754 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  37.6 
 
 		 807 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  39.38 
 
 		 726 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  36.96 
 
 		 762 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  36.39 
 
 		 706 aa  372  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  36.98 
 
 		 744 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  36.78 
 
 		 739 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  36.31 
 
 		 731 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.28 
 
 		 742 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  37.26 
 
 		 707 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.11 
 
 		 851 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.5 
 
 		 694 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.04 
 
 		 831 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.16 
 
 		 763 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.7 
 
 		 795 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.7 
 
 		 794 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.46 
 
 		 765 aa  365  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.79 
 
 		 756 aa  365  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.77 
 
 		 639 aa  364  3e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.69 
 
 		 711 aa  363  6e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  35.85 
 
 		 678 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.44 
 
 		 762 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.36 
 
 		 781 aa  362  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.68 
 
 		 741 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.49 
 
 		 730 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  37.68 
 
 		 696 aa  361  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.21 
 
 		 785 aa  361  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  36.79 
 
 		 770 aa  361  2e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.21 
 
 		 797 aa  361  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  37.66 
 
 		 726 aa  361  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  36.74 
 
 		 659 aa  360  4e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.4 
 
 		 806 aa  360  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.66 
 
 		 838 aa  360  6e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  35.39 
 
 		 639 aa  360  6e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  36.38 
 
 		 736 aa  359  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.93 
 
 		 786 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2483  DNA helicase II  35.75 
 
 		 807 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  36.18 
 
 		 666 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  36.24 
 
 		 680 aa  357  3.9999999999999996e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.55 
 
 		 732 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.7 
 
 		 757 aa  357  5e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.56 
 
 		 766 aa  357  5e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.56 
 
 		 829 aa  356  5.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.03 
 
 		 773 aa  356  8.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  36.31 
 
 		 665 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  35.98 
 
 		 721 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.07 
 
 		 1023 aa  354  2e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  40.22 
 
 		 715 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  37.98 
 
 		 732 aa  353  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  36.31 
 
 		 755 aa  353  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  37.34 
 
 		 787 aa  353  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.6 
 
 		 669 aa  353  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  35.12 
 
 		 741 aa  353  7e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.45 
 
 		 743 aa  352  8e-96  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.66 
 
 		 748 aa  353  8e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.25 
 
 		 669 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.01 
 
 		 671 aa  352  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  36.31 
 
 		 678 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.25 
 
 		 669 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  37.38 
 
 		 671 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.22 
 
 		 669 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.3 
 
 		 671 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  36.82 
 
 		 779 aa  350  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  37.02 
 
 		 789 aa  350  3e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.74 
 
 		 741 aa  351  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.56 
 
 		 758 aa  350  3e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  35.38 
 
 		 735 aa  350  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  37.18 
 
 		 731 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.22 
 
 		 747 aa  350  6e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.87 
 
 		 857 aa  349  7e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.22 
 
 		 747 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  35.48 
 
 		 768 aa  349  7e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.22 
 
 		 673 aa  349  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.22 
 
 		 751 aa  349  8e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  35.22 
 
 		 753 aa  349  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  35.22 
 
 		 751 aa  349  8e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.74 
 
 		 753 aa  349  8e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.54 
 
 		 747 aa  349  8e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.22 
 
 		 751 aa  349  8e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.22 
 
 		 751 aa  349  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  35.77 
 
 		 720 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>