More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5264 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03656  DNA helicase and single-stranded DNA-dependent ATPase  54.19 
 
 		 673 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0354982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4199  ATP-dependent DNA helicase Rep  54.04 
 
 		 673 aa  716    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3990  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.19 
 
 		 670 aa  699    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  99.4 
 
 		 669 aa  1377    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  100 
 
 		 669 aa  1382    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  84.01 
 
 		 669 aa  1169    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  55.84 
 
 		 673 aa  741    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00076  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.93 
 
 		 671 aa  684    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.57 
 
 		 667 aa  694    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.65 
 
 		 674 aa  716    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.89 
 
 		 674 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  54.69 
 
 		 677 aa  739    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3651  ATP-dependent DNA helicase Rep  58.92 
 
 		 682 aa  793    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4325  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.64 
 
 		 671 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  89.54 
 
 		 669 aa  1265    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4143  ATP-dependent DNA helicase Rep  54.04 
 
 		 673 aa  715    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.89 
 
 		 674 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  51.1 
 
 		 685 aa  693    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2868  ATP-dependent DNA helicase Rep  52.56 
 
 		 665 aa  678    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  52.87 
 
 		 665 aa  683    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  89.09 
 
 		 669 aa  1260    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  52.29 
 
 		 677 aa  687    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3599  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.49 
 
 		 670 aa  691    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.73 
 
 		 675 aa  721    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  55.59 
 
 		 668 aa  734    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  88.94 
 
 		 669 aa  1238    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4012  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.04 
 
 		 670 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03605  hypothetical protein  54.19 
 
 		 673 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.89 
 
 		 674 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.04 
 
 		 685 aa  697    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4147  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.8 
 
 		 670 aa  709    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0515139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  81.32 
 
 		 669 aa  1120    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  52.37 
 
 		 677 aa  709    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  55.74 
 
 		 674 aa  744    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.89 
 
 		 674 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4007  ATP-dependent DNA helicase Rep  54.18 
 
 		 673 aa  726    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00646067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3994  ATP-dependent DNA helicase Rep  54.19 
 
 		 673 aa  718    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2555  ATP-dependent DNA helicase Rep  55.51 
 
 		 671 aa  746    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614472  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  50.95 
 
 		 679 aa  685    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3913  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.04 
 
 		 670 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  61.76 
 
 		 672 aa  858    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0199  ATP-dependent DNA helicase Rep  52.99 
 
 		 674 aa  706    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0406  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.49 
 
 		 670 aa  694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  61.76 
 
 		 682 aa  853    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  52.29 
 
 		 677 aa  687    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  86.25 
 
 		 706 aa  1196    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.89 
 
 		 707 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  100 
 
 		 669 aa  1382    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0070  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.43 
 
 		 671 aa  720    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  55.99 
 
 		 673 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0360  ATP-dependent DNA helicase Rep  52.69 
 
 		 671 aa  696    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.69251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4288  ATP-dependent DNA helicase Rep  54.19 
 
 		 673 aa  719    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  50 
 
 		 670 aa  676    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0376  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.49 
 
 		 671 aa  695    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.158989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3650  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.49 
 
 		 671 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0305  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.49 
 
 		 670 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0428  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.19 
 
 		 670 aa  691    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12866  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  55.51 
 
 		 671 aa  763    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  55.51 
 
 		 671 aa  766    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  85.95 
 
 		 669 aa  1194    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4142  ATP-dependent DNA helicase Rep  54.19 
 
 		 673 aa  718    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4225  ATP-dependent DNA helicase Rep  54.19 
 
 		 673 aa  718    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  52.75 
 
 		 670 aa  723    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  99.25 
 
 		 669 aa  1375    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.74 
 
 		 671 aa  718    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0374  ATP-dependent DNA helicase Rep  51.64 
 
 		 671 aa  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  54.45 
 
 		 671 aa  747    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  55.84 
 
 		 673 aa  741    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.73 
 
 		 673 aa  723    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3266  ATP-dependent DNA helicase Rep  53.28 
 
 		 670 aa  704    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5211  ATP-dependent DNA helicase Rep  54.19 
 
 		 673 aa  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  54.19 
 
 		 669 aa  723    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  61.05 
 
 		 672 aa  847    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.28 
 
 		 663 aa  632  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  49.56 
 
 		 688 aa  626  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  51.02 
 
 		 663 aa  626  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.44 
 
 		 690 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  48.73 
 
 		 662 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  48.73 
 
 		 662 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.51 
 
 		 658 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.41 
 
 		 658 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  47.31 
 
 		 731 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0146  UvrD/REP helicase  47.09 
 
 		 721 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728084  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0166  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.81 
 
 		 660 aa  565  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3329  UvrD/REP helicase  46.41 
 
 		 695 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544954  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0149  UvrD/REP helicase  46.26 
 
 		 695 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0163  UvrD/REP helicase  46.41 
 
 		 695 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2905  UvrD/REP helicase  46.41 
 
 		 695 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306179  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0137  UvrD/REP helicase  46.26 
 
 		 695 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0150  UvrD/REP helicase  46.41 
 
 		 695 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275527  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3877  UvrD/REP helicase  46.13 
 
 		 696 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0060  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.13 
 
 		 696 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3260  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.86 
 
 		 848 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  45.97 
 
 		 658 aa  555  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3919  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.41 
 
 		 695 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0828794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0122  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.41 
 
 		 733 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3991  ATP-dependent DNA helicase Rep  46.41 
 
 		 695 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.38 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3478  ATP-dependent DNA helicase Rep  44.51 
 
 		 695 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3158  UvrD/REP helicase  45.63 
 
 		 706 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154088  normal  0.513844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>