More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0577 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  100 
 
 
743 aa  1529    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.53 
 
 
730 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.53 
 
 
730 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.12 
 
 
729 aa  459  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 
731 aa  452  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.73 
 
 
772 aa  449  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  36.36 
 
 
744 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.33 
 
 
729 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.18 
 
 
742 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.59 
 
 
741 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.87 
 
 
757 aa  438  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  35.02 
 
 
739 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.14 
 
 
732 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.49 
 
 
753 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.68 
 
 
747 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.97 
 
 
759 aa  432  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.6 
 
 
753 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.66 
 
 
751 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  39.66 
 
 
753 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  39.66 
 
 
751 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.22 
 
 
737 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.66 
 
 
751 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.66 
 
 
747 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.36 
 
 
715 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.66 
 
 
751 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  38.47 
 
 
757 aa  428  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  39.22 
 
 
705 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.94 
 
 
785 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.78 
 
 
747 aa  425  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.77 
 
 
755 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  35.38 
 
 
736 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.75 
 
 
765 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  37.26 
 
 
714 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  37.5 
 
 
724 aa  419  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  34.05 
 
 
753 aa  417  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  34.72 
 
 
770 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.23 
 
 
711 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.27 
 
 
748 aa  415  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.97 
 
 
766 aa  415  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  35.46 
 
 
726 aa  412  1e-113  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.36 
 
 
730 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.3 
 
 
694 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  35.23 
 
 
707 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.65 
 
 
741 aa  412  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  35.22 
 
 
742 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  33.38 
 
 
770 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.6 
 
 
758 aa  408  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.79 
 
 
786 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  37.36 
 
 
672 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  37.19 
 
 
762 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  34.64 
 
 
731 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2436  UvrD/REP helicase  34.22 
 
 
778 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0016628  normal  0.650689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  35.91 
 
 
746 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  34.68 
 
 
732 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.24 
 
 
725 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.49 
 
 
718 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  36.85 
 
 
678 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  34.72 
 
 
706 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.57 
 
 
756 aa  402  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  33.69 
 
 
751 aa  399  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  32.88 
 
 
758 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  37.83 
 
 
787 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  33.55 
 
 
799 aa  398  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  35.93 
 
 
755 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  35.44 
 
 
764 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  36.91 
 
 
735 aa  395  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  33.88 
 
 
728 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.23 
 
 
892 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  34.35 
 
 
738 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.24 
 
 
768 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  31.89 
 
 
760 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.59 
 
 
806 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  35.56 
 
 
696 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.64 
 
 
763 aa  395  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  32.54 
 
 
790 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.57 
 
 
738 aa  392  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.8 
 
 
794 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  32.5 
 
 
759 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  38.63 
 
 
689 aa  390  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  32.6 
 
 
709 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  34.4 
 
 
738 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  33.07 
 
 
816 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.69 
 
 
765 aa  392  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  34.61 
 
 
726 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  36.55 
 
 
678 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.68 
 
 
795 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.87 
 
 
802 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.47 
 
 
751 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.32 
 
 
751 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  32.6 
 
 
709 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  39.17 
 
 
807 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  33.89 
 
 
795 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  37.23 
 
 
678 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.97 
 
 
773 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2037  UvrD/REP helicase  31.59 
 
 
850 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114912  normal  0.635195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  33.76 
 
 
798 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  32 
 
 
812 aa  387  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.96 
 
 
1023 aa  387  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.98 
 
 
772 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 
725 aa  389  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>