More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0382 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.72 
 
 		 747 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  55.63 
 
 		 841 aa  907    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  57.2 
 
 		 772 aa  902    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.84 
 
 		 753 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0950  UvrD/REP helicase  56.24 
 
 		 813 aa  873    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000846771 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 812 aa  1676    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.25 
 
 		 751 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  43.03 
 
 		 753 aa  633  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  42.84 
 
 		 751 aa  632  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.84 
 
 		 751 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.91 
 
 		 753 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.23 
 
 		 741 aa  632  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.13 
 
 		 751 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.13 
 
 		 747 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.11 
 
 		 732 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.12 
 
 		 747 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.21 
 
 		 757 aa  620  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.59 
 
 		 755 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  42.51 
 
 		 757 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.77 
 
 		 759 aa  608  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  41.95 
 
 		 770 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.16 
 
 		 754 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.46 
 
 		 730 aa  602  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.46 
 
 		 730 aa  602  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.86 
 
 		 729 aa  598  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.33 
 
 		 737 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.97 
 
 		 718 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.56 
 
 		 756 aa  595  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.66 
 
 		 730 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.83 
 
 		 725 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.98 
 
 		 781 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.98 
 
 		 766 aa  588  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  42.13 
 
 		 746 aa  581  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.61 
 
 		 768 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.86 
 
 		 758 aa  580  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.49 
 
 		 802 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.77 
 
 		 851 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  41.71 
 
 		 768 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.86 
 
 		 817 aa  569  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.07 
 
 		 831 aa  571  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.1 
 
 		 830 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.53 
 
 		 781 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.42 
 
 		 741 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.44 
 
 		 715 aa  565  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.88 
 
 		 858 aa  567  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.22 
 
 		 742 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.22 
 
 		 837 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.64 
 
 		 751 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  43.7 
 
 		 736 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.56 
 
 		 748 aa  565  1.0000000000000001e-159  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  41.57 
 
 		 707 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.07 
 
 		 765 aa  562  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.97 
 
 		 751 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  40.42 
 
 		 739 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.09 
 
 		 857 aa  556  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.31 
 
 		 694 aa  558  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.05 
 
 		 773 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.25 
 
 		 795 aa  555  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.94 
 
 		 784 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.76 
 
 		 864 aa  555  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  39.35 
 
 		 738 aa  552  1e-156  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.38 
 
 		 794 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.6 
 
 		 785 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.41 
 
 		 858 aa  551  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.6 
 
 		 785 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.23 
 
 		 780 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  39.85 
 
 		 735 aa  546  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  40.84 
 
 		 732 aa  548  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  40.51 
 
 		 771 aa  548  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.89 
 
 		 828 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.09 
 
 		 786 aa  545  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 779 aa  544  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.48 
 
 		 775 aa  545  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  40.22 
 
 		 731 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  39.23 
 
 		 762 aa  542  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.65 
 
 		 932 aa  538  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.47 
 
 		 806 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.7 
 
 		 762 aa  539  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.4 
 
 		 849 aa  538  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.05 
 
 		 814 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  39.31 
 
 		 741 aa  537  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.31 
 
 		 797 aa  538  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  38.59 
 
 		 739 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  39.33 
 
 		 743 aa  533  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  38.96 
 
 		 729 aa  532  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  39.5 
 
 		 727 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  39.11 
 
 		 743 aa  531  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.51 
 
 		 729 aa  532  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.58 
 
 		 817 aa  531  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.28 
 
 		 833 aa  529  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.34 
 
 		 896 aa  528  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  38.65 
 
 		 728 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  39.07 
 
 		 735 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  39.66 
 
 		 742 aa  528  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  38.51 
 
 		 728 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  39.36 
 
 		 790 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  38.65 
 
 		 728 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  38.42 
 
 		 892 aa  527  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  39.45 
 
 		 783 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.27 
 
 		 1023 aa  524  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>