82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1210 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  92.61 
 
 		 251 aa  462  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  74.32 
 
 		 254 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  72.37 
 
 		 258 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  60.24 
 
 		 260 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0147  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  75 
 
 		 128 aa  203  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.138783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2080  hypothetical protein  47.26 
 
 		 193 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365514  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0327  hypothetical protein  45.54 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00781136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1335  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  46.88 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0670  hypothetical protein  47.55 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000833206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2372  hypothetical protein  38.12 
 
 		 188 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3165  hypothetical protein  40.09 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1181  hypothetical protein  65.22 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0202  hypothetical protein  61.96 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000154099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0219  hypothetical protein  61.96 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.925782  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  65.79 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  59.46 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2011  hypothetical protein  28.75 
 
 		 185 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.515904  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  62.16 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  63.16 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  54.05 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  41.38 
 
 		 355 aa  58.9  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  61.11 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  53.85 
 
 		 730 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  40.54 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  50 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  59.46 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  35.44 
 
 		 739 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  30.77 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  51.52 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  44.74 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  54.29 
 
 		 348 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  39.34 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  38.03 
 
 		 154 aa  52.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.583488  normal  0.69553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  36.73 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  47.5 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  44.68 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  58.33 
 
 		 744 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  48.48 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  41.94 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  42.5 
 
 		 671 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  48.78 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2172  hypothetical protein  47.17 
 
 		 98 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  30.11 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  42.5 
 
 		 671 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  42.5 
 
 		 670 aa  46.2  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 696 aa  46.2  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  39.66 
 
 		 711 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  42.5 
 
 		 670 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  45.71 
 
 		 696 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  28.26 
 
 		 686 aa  45.8  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  40 
 
 		 671 aa  45.8  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  52.94 
 
 		 859 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  40 
 
 		 670 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  51.52 
 
 		 836 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  40 
 
 		 676 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  40 
 
 		 676 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  45 
 
 		 670 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  33.82 
 
 		 813 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  45.95 
 
 		 760 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  48.48 
 
 		 694 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  44.74 
 
 		 765 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  44.74 
 
 		 676 aa  43.9  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  45 
 
 		 440 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0558  DNA topoisomerase III  27.17 
 
 		 680 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  45 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  32.43 
 
 		 748 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  48.48 
 
 		 779 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  33.87 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  45.71 
 
 		 768 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  44.12 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  48.48 
 
 		 779 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  44.44 
 
 		 751 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  37.5 
 
 		 655 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 708 aa  42.7  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  38.78 
 
 		 793 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  40 
 
 		 670 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  30.56 
 
 		 703 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  30.56 
 
 		 703 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  36.84 
 
 		 747 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  38.6 
 
 		 691 aa  42  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>