18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2080 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2080  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365514  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0327  hypothetical protein  55.19 
 
 		 205 aa  202  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00781136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  51.26 
 
 		 260 aa  197  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1335  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  46.63 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0670  hypothetical protein  47.29 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000833206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2372  hypothetical protein  51.08 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  47.26 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  44.95 
 
 		 258 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0219  hypothetical protein  44.78 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.925782  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  43.2 
 
 		 254 aa  165  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  46.41 
 
 		 251 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1181  hypothetical protein  70.87 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0202  hypothetical protein  69.9 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000154099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3165  hypothetical protein  43.5 
 
 		 228 aa  151  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0147  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  54.55 
 
 		 128 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.138783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2011  hypothetical protein  27.95 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.515904  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2172  hypothetical protein  46.81 
 
 		 98 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0916  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>