19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1335 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1335  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  100 
 
 		 209 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  58.67 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2080  hypothetical protein  48.08 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365514  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  49.74 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0202  hypothetical protein  44.81 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000154099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0670  hypothetical protein  47.66 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000833206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  48.69 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0219  hypothetical protein  46.93 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.925782  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  44.33 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3165  hypothetical protein  43.86 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  44.79 
 
 		 254 aa  147  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0327  hypothetical protein  44.04 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00781136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1181  hypothetical protein  64.55 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2372  hypothetical protein  39.2 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0147  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  49.21 
 
 		 128 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.138783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2011  hypothetical protein  31.14 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.515904  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0916  hypothetical protein  44.59 
 
 		 84 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2172  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2765  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  28.89 
 
 		 890 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0345886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>