18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1181 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1181  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0670  hypothetical protein  68.35 
 
 		 207 aa  317  7.999999999999999e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000833206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0202  hypothetical protein  67.21 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000154099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0219  hypothetical protein  69.92 
 
 		 236 aa  298  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.925782  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3165  hypothetical protein  58.19 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  42.8 
 
 		 260 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2080  hypothetical protein  70.87 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365514  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1335  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  44.3 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2372  hypothetical protein  37.23 
 
 		 188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  38.89 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  40.44 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0327  hypothetical protein  62.75 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00781136  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  41.59 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  65.22 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0147  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  62.89 
 
 		 128 aa  122  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.138783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2011  hypothetical protein  32 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.515904  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2172  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0916  hypothetical protein  60.47 
 
 		 84 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>