31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0202 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0202  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000154099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0219  hypothetical protein  84.34 
 
 		 236 aa  363  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.925782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0670  hypothetical protein  64.34 
 
 		 207 aa  291  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000833206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1181  hypothetical protein  82.95 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3165  hypothetical protein  54 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1335  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  44.81 
 
 		 209 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  40.98 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2080  hypothetical protein  69.9 
 
 		 193 aa  156  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365514  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0327  hypothetical protein  59.8 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00781136  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2372  hypothetical protein  57.89 
 
 		 188 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  61.96 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  63.04 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  63.04 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  60.87 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0147  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  61.96 
 
 		 128 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.138783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2172  hypothetical protein  63.83 
 
 		 98 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2011  hypothetical protein  28.8 
 
 		 185 aa  62  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.515904  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0916  hypothetical protein  58 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  45.95 
 
 		 813 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  57.45 
 
 		 347 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  57.45 
 
 		 347 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1259  hypothetical protein  56.52 
 
 		 403 aa  45.8  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.459414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  46.38 
 
 		 1426 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  46.15 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  37.84 
 
 		 2851 aa  43.5  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  41.25 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  50.75 
 
 		 426 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  60.98 
 
 		 300 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  44.62 
 
 		 582 aa  42  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  46.91 
 
 		 295 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>