86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1259 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1259  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  744    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.459414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  46.81 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  54.63 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  50.32 
 
 		 462 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  47.22 
 
 		 606 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  55.75 
 
 		 274 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  50 
 
 		 524 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  60.55 
 
 		 815 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  53.79 
 
 		 1055 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  55.45 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  55.45 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  50.34 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  35.81 
 
 		 706 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  60.91 
 
 		 1219 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  41.51 
 
 		 813 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  47.59 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  50 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  38.94 
 
 		 936 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  44.64 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  55.34 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  40 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  34.2 
 
 		 748 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  49.29 
 
 		 639 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  42.54 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  43.95 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  43.2 
 
 		 1168 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  38.61 
 
 		 512 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  50.46 
 
 		 252 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  45.79 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  48.21 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  40.94 
 
 		 1147 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  52.73 
 
 		 348 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  51.4 
 
 		 258 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  39.17 
 
 		 523 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  41.12 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  44.06 
 
 		 481 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  44.06 
 
 		 478 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  44.55 
 
 		 492 aa  53.5  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  47.12 
 
 		 283 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  41.51 
 
 		 582 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  42.73 
 
 		 493 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  35.67 
 
 		 643 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  49.61 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  45.79 
 
 		 240 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4079  BclA protein  45.36 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  37.38 
 
 		 437 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1117  triple helix repeat-containing collagen  73.81 
 
 		 292 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  54.17 
 
 		 1101 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  38.32 
 
 		 451 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  37.38 
 
 		 437 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  30.3 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2464  BclA protein  61.54 
 
 		 210 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  49.61 
 
 		 647 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  61.7 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  43.93 
 
 		 835 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  44.88 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  35.93 
 
 		 842 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  37.38 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  42.99 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  47.66 
 
 		 1451 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  47.52 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  41.22 
 
 		 1297 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  38.79 
 
 		 645 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  36.94 
 
 		 585 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  38.32 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  46.9 
 
 		 1321 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4274  collagen-like protein  73.17 
 
 		 327 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  36.45 
 
 		 2851 aa  47  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  35.26 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4887  collagen triple helix repeat protein  65.96 
 
 		 305 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  37.93 
 
 		 2914 aa  46.6  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  36.94 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4423  triple helix repeat-containing collagen  49.54 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000283888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  43.4 
 
 		 838 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  32.31 
 
 		 212 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4893  collagen triple helix repeat protein  55.38 
 
 		 230 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  40.76 
 
 		 1580 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  45.79 
 
 		 835 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  36.45 
 
 		 1426 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  33.94 
 
 		 322 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  34.48 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4639  collagen triple helix repeat domain protein  68.09 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  34.48 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  39.23 
 
 		 867 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  38.17 
 
 		 1170 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4764  hypothetical protein  65.22 
 
 		 249 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0280415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>