16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2372 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2372  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  394  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0327  hypothetical protein  53.55 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00781136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2080  hypothetical protein  51.08 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365514  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  43.22 
 
 		 260 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  41.33 
 
 		 258 aa  147  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  38.12 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  38.46 
 
 		 254 aa  142  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0670  hypothetical protein  41.75 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000833206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0219  hypothetical protein  39.22 
 
 		 236 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.925782  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  39.01 
 
 		 251 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1335  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  39.7 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0202  hypothetical protein  57.89 
 
 		 249 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000154099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3165  hypothetical protein  58.04 
 
 		 228 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1181  hypothetical protein  59.05 
 
 		 237 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0147  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  48.62 
 
 		 128 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.138783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2011  hypothetical protein  26.04 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.515904  normal  0.333108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>