114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2098 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  92.61 
 
 		 257 aa  474  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  76.89 
 
 		 254 aa  407  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  72.05 
 
 		 258 aa  387  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  60.16 
 
 		 260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0147  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  75 
 
 		 128 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.138783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2080  hypothetical protein  45.92 
 
 		 193 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365514  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0327  hypothetical protein  45.41 
 
 		 205 aa  169  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00781136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1335  DNA topoisomerase, type IA, zn finger domain protein  44.79 
 
 		 209 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2372  hypothetical protein  39.29 
 
 		 188 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0670  hypothetical protein  45.59 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000833206  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3165  hypothetical protein  53.49 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1181  hypothetical protein  64.13 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0219  hypothetical protein  60.87 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.925782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0202  hypothetical protein  60.87 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000154099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  68.42 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2011  hypothetical protein  31.41 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.515904  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  59.46 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  62.16 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  64.86 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  65.79 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  44.83 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  49.02 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  55.26 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  59.46 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  56.41 
 
 		 730 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  41.89 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  55.26 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  29.14 
 
 		 154 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.583488  normal  0.69553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  36.25 
 
 		 739 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  50 
 
 		 329 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  54.55 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  42.62 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  57.14 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  51.43 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  38.78 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  25.95 
 
 		 813 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  50 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  61.11 
 
 		 744 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  51.52 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  46.81 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  45 
 
 		 671 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  25.37 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  43.55 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  51.22 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  29.2 
 
 		 686 aa  49.7  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  45 
 
 		 671 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  41.38 
 
 		 711 aa  48.5  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  45 
 
 		 670 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  45 
 
 		 670 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  42.5 
 
 		 671 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  55.88 
 
 		 859 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  42.5 
 
 		 670 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  54.55 
 
 		 836 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  42.5 
 
 		 676 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  42.5 
 
 		 676 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  47.5 
 
 		 670 aa  46.2  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  51.52 
 
 		 694 aa  46.2  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  47.06 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  51.52 
 
 		 779 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  51.52 
 
 		 779 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  48.57 
 
 		 768 aa  45.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0558  DNA topoisomerase III  29.35 
 
 		 680 aa  45.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  45.71 
 
 		 696 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  40.43 
 
 		 793 aa  45.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  40 
 
 		 655 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 696 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  33.87 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  42.5 
 
 		 670 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  53.12 
 
 		 708 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  30.99 
 
 		 765 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  51.52 
 
 		 845 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3449  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  42.5 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  45.95 
 
 		 760 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  36.67 
 
 		 692 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  40 
 
 		 691 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  38.89 
 
 		 798 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  26.71 
 
 		 758 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  39.66 
 
 		 691 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  46.88 
 
 		 684 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  44.74 
 
 		 676 aa  43.5  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  48.48 
 
 		 783 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2172  hypothetical protein  43.4 
 
 		 98 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  38.46 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  32.43 
 
 		 748 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  42.42 
 
 		 841 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  40 
 
 		 802 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  44.44 
 
 		 666 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  51.52 
 
 		 851 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  51.52 
 
 		 851 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  31.94 
 
 		 703 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  38.18 
 
 		 706 aa  42.7  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  43.9 
 
 		 708 aa  42.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2529  DNA topoisomerase III  37.97 
 
 		 722 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  37.18 
 
 		 654 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  31.94 
 
 		 703 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02181  hypothetical protein  38.46 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  44.44 
 
 		 751 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  37.04 
 
 		 804 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  42.5 
 
 		 327 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>