28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003651 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  100 
 
 		 219 aa  453  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02181  hypothetical protein  88.58 
 
 		 220 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1205  hypothetical protein  70.32 
 
 		 229 aa  352  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0604166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30.77 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  33.57 
 
 		 192 aa  88.6  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  35.2 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  24.19 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  28.47 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0540  hypothetical protein  22.7 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01628  hypothetical protein  23.53 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  25.2 
 
 		 174 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4785  hypothetical protein  21.62 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00673705  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  23.33 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  40.74 
 
 		 744 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  32.84 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1551  hypothetical protein  25.58 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  33.33 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  51.43 
 
 		 739 aa  45.1  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  35 
 
 		 758 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  38.46 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  28 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  41.03 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  25.81 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  28 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  33.33 
 
 		 812 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  41.67 
 
 		 260 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  48.57 
 
 		 708 aa  42.4  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  33.33 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>