25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1205 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1205  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0604166  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02181  hypothetical protein  68.18 
 
 		 220 aa  345  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003651  QueD-like protein  69.65 
 
 		 219 aa  324  6e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  40.8 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  27.55 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  24.49 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0540  hypothetical protein  23.24 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1551  hypothetical protein  27.12 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  23.62 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  27.15 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01628  hypothetical protein  19.61 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  30.21 
 
 		 812 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  34.38 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  24.48 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  44.44 
 
 		 841 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4785  hypothetical protein  22.22 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00673705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  40.35 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  31.48 
 
 		 267 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  38.89 
 
 		 744 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  30.21 
 
 		 817 aa  42  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  41.18 
 
 		 338 aa  42  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  41.03 
 
 		 260 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0280  hypothetical protein  23.53 
 
 		 196 aa  42  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235416  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  43.75 
 
 		 251 aa  41.6  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>